Публикации и материалы конференций Лаборатории хромосомной инженерии

2019

• Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Боксорн АЮ, Кашинская ЮО, Штоль ДА. Новые данные о распространении домового сыча в Новосибирской области и северной части Алтайского края, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2019-39-282-285) Пернатые хищники и их охрана 39: 282-285, 2019

• Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Дубиковский ДВ, Урусов ЛВ, Жимулев ИФ. Новые данные о гнездовании бородатой неясыти в лесостепной зоне Новосибирской области, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2019-39-275-281) Пернатые хищники и их охрана 39: 275-281, 2019

• Карякин ИВ, Николенко ЭГ, Шнайдер ЕП, Зиневич ЛС, Пуликова ГИ, Бартошук К, Хорват М, Юхаш Т, Агабабян К, Андреенкова НГ. Результаты GPS/GSM-трекинга ювенильных степных орлов из России и Казахстана. (doi: 10.19074/1814-8654-2019-39-71-227) Пернатые хищники и их охрана 39: 71-227, 2019

• Volkova EI, Andreyenkova NG, Andreyenkov OV, Sidorenko DS, Zhimulev IF, Demakov SA.  Structural and functional dissection of the 5’ region of the Notch gene in Drosophila melanogaster. (doi: 10.3390/genes10121037) Genes 10(12): 1037, 2019

• Зыкова ТЮ, Левицкий ВГ, Жимулев ИФ. Архитектура промоторов генов "домашнего хозяйства" в междисках политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0869-56524851104-109) Доклады Академии Наук 485(1): 104-109, 2019

• Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TY, Goncharov FP, Larsson J, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s00412-019-00703-x) Chromosoma 128(2): 97-117, 2019

• Хорошко ВА, Похолкова ГВ, Зыкова ТЮ, Осадчий ИС, Жимулев ИФ. Локализация гена dunce в большой серии близлежащих структур политенной хромосомы Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0869-56524844507-510) Доклады Академии Наук 484(4): 507-510, 2019

• Andreyenkova NG, Starikov IJ, Wink M, Karyakin IV, Andreyenkov OV, Zhimulev IF. The problems of genetic support of dividing the black kite (Milvus migrans) into subspecies. (doi: 10.18699/VJ19.486) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 226-231, 2019

• Andreyenkov OV, Volkova EI, Andreyenkova NG, Demakov SA. The study of the regulatory region of the Drosophila melanogaster Notch gene by new methods of directed genome editing. (doi: 10.18699/VJ19.482) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 199-202, 2019

• Schwartz (Berkaeva) MB, Pankova TE, Demakov SA. ADF1 and BEAF-32 chromatin proteins affect nucleosome positioning and DNA decompaction in 61C7/C8 interband region of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.18699/VJ19.475) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 154-159, 2019

• Sidorenko DS, Zykova TYu, Khoroshko VA, Pokholkova GV, Demakov SA, Larsson J, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes reflect functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.18699/VJ19.474) Вавиловский журнал генетики и селекции 23(2): 148-153, 2019

2018

• Андреенков ОВ, Андреенкова НГ. Обзор современных данных о состоянии популяции орлана-долгохвоста. (doi: 10.19074/1814-8654-2018-37-54-65) Пернатые хищники и их охрана 37: 54-65, 2018

• Сидоренко ДС. Четвертая хромосома – особый домен хроматина дрозофилы. Norwegian J Dev Int Sci 15(1): 13-19, 2018

• Зыкова ТЮ, Попова ОО, Хорошко ВА, Левицкий ВГ, Лавров СА, Жимулев ИФ. Генетическая организация доменов открытого типа, расположенных в междисках политенных хромосом дрозофилы. (doi: 10.31857/S086956520003420-5) Доклады Академии Наук 483(1): 98-102, 2018

• Андреенкова Н, Андреенков О, Карякин И, Жимулев И. Новые гаплотипы митохондриального гена CytB в гнездящейся популяции сибирского подвида черного коршуна Milvus migrans lineatus Gray, 1831 на территории республики Тыва. (doi: 10.31857/S086956520003206-9) Доклады Академии Наук 482(2): 217-219, 2018

• Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Попова ОО, Жимулев ИФ. Структура границ дисков интеркалярного гетерохроматина политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.7868/S0869565218110257) Доклады Академии Наук 479(5): 589-592, 2018

• Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of CHROMATOR and dCTCF proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes but does not affect their transcription and replication timing. (doi: 10.1371/journal.pone.0192634) PLoS ONE 13(4): e0192634, 2018

• Zykova TYu, Levitsky VG, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Polytene chromosomes – a portrait of functional organization of the Drosophila genome. (doi: 10.2174/1389202918666171016123830) Curr Genomics 19(3): 179-191, 2018

• Карякин ИВ, Николенко ЭГ, Андреенков ОВ, Андреенкова НГ. Обыкновенный и амурский кобчики в республике Тыва, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2018-36-136-141) Пернатые хищники и их охрана 36: 136-141, 2018 

• Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Волкова ЕИ, Демаков СА. Получение направленных делеций в регуляторной зоне гена Notch с использованием CRISPR/Cas-опосредованного метода редактирования геномов. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 92

• Zhimulev IF, Zykova TYu, Levitsky VG, Antonenko O, Belyaeva ES. A portrait of functional organization of the Drosophila genome – polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 88

• Zykova TYu, Levitsky VG, Zhimulev IF. Interband architecture in Drosophila polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с.89

• Sidorenko DS, Sidorenko IA, Zykova TYu, Kolesnikova TD, Goncharov FP, Zhimulev IF. Molecular and genetic organization of bands and interbands in the dot chromosome of Drosophila melanogaster. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 75

• Pokholkova GV, Demakov SA, Andreenkov OV, Andreenkova NG, Volkova EI, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of insulator proteins results in decompaction of condensed bands in the Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 60

• Khoroshko V, Pokholkova G, Zykova T, Zhimulev I. Gene location in intercalary heterochromatin bands of Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 32

• Andreyenkova NG, Andreyenkov OV, Karyakin IV, Popova OO, Zhimulev IF. Рhylogeography of the black kite (Milvus migrans) based on mitochondrial cytochrome b gene polymorphism. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 1

2017

• Boldyreva LV, Goncharov FP, Demakova OV, Zykova TYu, Levitsky VG, Kolesnikov NN, Pindyurin AV, Semeshin VF, Zhimulev IF. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines. (doi:  10.2174/1389202917666160512164913) Curr Genomics 18(2): 214-226, 2017

• Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Жимулёв ИФ, Фон Эйлер Ф. Первый факт гнездования сапсана на дереве в Сибири, Россия. (doi: 10.19074/1814-8654-2017-35-260-264) Пернатые хищники и их охрана 35: 260-264, 2017

2016

• Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА, Сия С, Дубровский ЭБ, Жимулев ИФ. Направленное удаление гена RNaseZ дрозофилы методом гомологичной рекомбинации. Доклады Академии Наук 471(2): 230-233, 2016

• Khoroshko VA, Levitsky VG, Zykova TY, Antonenko OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Chromatin heterogeneity and distribution of regulatory elements in the late-replicating intercalary heterochromatin domains of Drosophila melanogaster chromosomes. (doi: 10.1371/journal.pone.0157147) PLoS ONE 11(6): e0157147, 2016

• Демакова ОВ, Болдырева ЛВ, Демаков СА, Гончаров ФП, Антоненко ОВ, Жимулев ИФ. Характеристика хроматина тонких дисков политенных хромосом Drosophila melanogaster. Цитология 58: 248-252, 2016

• Демидова ДС, Демаков СА, Похолкова ГВ, Зыкова ТЮ, Жимулев ИФ. Комбинированный метод картирования политенных хромосом на примере 4-й микрохромосомы Drosophila melanogaster. Цитология 58: 253-257, 2016

• Зыкова ТЮ, Демидова ДС, Кокоза ЕБ, Жимулев ИФ. Локализация инсерций мобильных Р-элементов в доменах активного и репрессированного хроматина в геноме Drosophila melanogaster. Цитология 58: 258-261, 2016

• Pavlova GA, Galimova YuA, Popova YuV, Munzarova AF, Razuvaeva AV, Alekseeva AL, Berkaeva MB, Pindyurin AV, Somma MP, Gatti M, Renda F. Factors governing the pattern of spindle microtubule regrowth after tubulin depolymerization. Цитология 58: 299-303, 2016

• Андреенков ОВ, Андреенкова НГ, Волкова ЕИ, Георгиев ПГ, Гончарова АА, Похолкова ГВ, Демаков СА. Эктопическое привлечение белка Chromator в системе UAS>DBD(GAL4) как метод изучения инсуляторных белков в политенных хромосомах Drosophila melanogaster. Цитология 58: 493-496, 2016

• Жимулев ИФ, Болдырева ЛВ, Демакова ОВ, Похолкова ГВ, Хорошко ВА, Зыкова TЮ, Лавров СА, Беляева ЕС. Формирование дисков политенных хромосом из интронов генов у дрозофилы. Доклады Акад Наук 466(5): 607–610, 2016

2015

• Zykova T, Demidova D, Levitsky V, Khoroshko V, Belyaeva E, Kokoza E, Zhimulev I. Molecular and genetic structure of polytene chromosome banding pattern in Drosophila melanogaster. Athens: ATINER'S Conference Paper Series, No: BIO2015-1700: 4-15, 2015

• Pokholkova GV, Koryakov DE, Pindyurin AV, Kozhevnikova EN, Belyakin SN, Andreyenkov OV, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Tethering of SUUR and HP1 proteins results in delayed replication of euchromatic regions in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. (doi: 10.1007/s00412-014-0491-8) Chromosoma 124: 209-220, 2015

• Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Levitsky VG, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1007/s10577-014-9447-3) Chromosome Res 23: 409-410, 2015

2014

• Zhimulev IF, Zykova TYu, Goncharov FP, Khoroshko VA, Demakova OV, Semeshin VF, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Demidova DS, Babenko VN, Demakov SA, Belyaeva ES. Genetic organization of interphase chromosome bands and interbands in Drosophila melanogaster. (doi: 10.1371/journal.pone.0101631) PLoS ONE 9(7): e101631, 2014

• Makunin IV, Kolesnikova TD, Andreyenkova NG. Under-replicated regions in D. melanogaster are enriched with fast evolving genes and highly conserved noncoding sequences. (doi: 10.1093/gbe/evu156) Genome Biol Evol 6: 2050-2060, 2014

• Похолкова ГВ, Коряков ДЕ, Пиндюрин АВ, Андреенков ОВ, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Искусственное привлечение гетерохроматиновых белков SUUR и HP1 в районы открытого хроматина приводит к замедлению движения репликационной вилки. Цитология 56: 677, 2014

2013

• Andreyenkova NG, Kolesnikova TD, Makunin IV, Pokholkova GV, Boldyreva LV, Zykova TYu, Zhimulev IF, Belyaeva ES. Late replication domains are evolutionary conserved in the Drosophila genome. (doi: 10.1371/journal.pone.0083319) PLoS ONE 8(12): e83319, 2013

• Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Зыкова (Ватолина) ТЮ, Семешин ВФ, Демаков СА, Демакова ОВ, Гончаров ФП, Хорошко ВА, Болдырева ЛВ, Кокоза ЕБ. Хромосомная организация генома у дрозофилы. Цитология 55: 144-147, 2013

• Колесникова ТД, Андреенкова НГ, Беляева ЕС, Гончаров ФП, Зыкова ТЮ, Болдырева ЛВ, Похолкова ГВ, Жимулев ИФ. Районы поздней репликации политенных хромосом слюнных желез Drosophila melanogaster. Цитология 55: 178-180, 2013

• Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Семешин ВФ, Жимулев ИФ, Демаков СА. Структурные особенности организации хроматина междиска 3С6/С7 политенных хромосом Drosophila melanogaster. Цитология 55: 198-203, 2013

• Dubatolova TD, Volkova EI, Omelyanchuk LV. Drosophila splicing factor SF2 knock-down mutant shows altered cell cycle in vivo. (doi: 10.1002/cbin.10019) Cell Biol Int 37: 187-190, 2013

2012

• Zhimulev IF, Belyaeva ES, Vatolina TYu, Demakov SA. Banding patterns in Drosophila melanogaster polytene chromosomes correlate with DNA-binding protein occupancy. BioEssays 34: 498-508, 2012

2011

• Vatolina TYu, Boldyreva LV, Demakova OV, Demakov SA, Kokoza EB, Semeshin VF, Babenko VN, Goncharov FP, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Identical functional organization of cell line interphase and polytene chromosomes in Drosophila melanogaster. PLoS ONE 6(10): e25960, 2011

• Demakov SA, Vatolina TYu, Babenko VN, Semeshin VF, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Protein composition of interband regions in polytene and cell line chromosomes of Drosophila melanogaster. BMC Genomics 12: 566, 2011

• Ватолина ТЮ, Демаков СА, Семешин ВФ, Макунин ИВ, Бабенко ВН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Идентификация и молекулярно-генетическая характеристика междисков политенных хромосом Drosophila melanogaster. Генетика 47: 597-609, 2011

• Копыл СА, Дубатолова ТД, Волкова ЕИ, Мариловцева ЕВ, Омельянчук ЛВ. Влияние морфогена Wg на формирование эктопического глаза у Drosophila melanogaster. Генетика 47: 1026-1031, 2011

• Иванкин АВ, Колесникова ТД, Демаков СА, Андреенков ОВ, Бильданова ЕР, Андреенкова НГ, Жимулев ИФ. Метод молекулярного комбинга в исследовании параметров репликации ДНК в изолированных органах Drosophila melanogaster. Цитология 53: 75-82, 2011

• Квон ЕЗ, Демаков СА, Жимулев ИФ. Декомпактизация хроматина в междисках политенных хромосом дрозофилы не коррелирует с высоким уровнем транскрипции. Генетика 47: 765-773, 2011

2010

• Демаков СА, Андреенков ОВ, Беркаева МБ, Ватолина ТЮ, Волкова ЕИ, Квон ЕЗ, Семешин ВФ, Жимулев ИФ. Функциональная организация междисков политенных хромосом дрозофилы. Генетика 46: 1421-1423, 2010

• Жимулев ИФ, Беляева ЕС, Андреева ЕН, Андреенкова НГ, Бабенко ВН, Белякин СН, Болдырева ЛВ, Брусенцова ИВ, Демаков СА, Демакова ОВ, Зыков ИА, Кокоза ЕБ, Колесникова ТД, Максимов ДА, Макунин ИВ, Пиндюрин АВ, Семешин ВФ, Хорошко ВА. Интеркалярный гетерохроматин в геноме дрозофилы. Генетика 46: 1405-1408, 2010

• Колесникова ТД, Демаков СА, Иванкин АВ, Жимулев ИФ. Метод молекулярного комбинга в исследовании организации геномов и репликации ДНК. Адаптация метода для исследований на дрозофиле. Генетика 46: 1409-1412, 2010

• Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА, Семешин ВФ, Жимулев ИФ. Декомпактное состояние хроматина междиска из района 3С6/С7 политенных хромосом D. melanogaster определяется короткой последовательностью ДНК. Доклады Академии Наук 431: 119-122, 2010

2009

• Andreyenkova NG, Kokoza EB, Semeshin VE, Belyaeva ES, Demakov SA, Pindyurin AV, Andreyeva EN, Volkova EI, Zhimulev IF. Localization and characteristics of DNA underreplication zone in the 75C region of intercalary heterochromatin in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 118: 747-761, 2009

• Berkaeva MB, Demakov SA, Schwartz YB, Zhimulev IF. Functional analysis of Drosophila polytene chromosomes decompacted unit: the interband. Сhromosome Res 17: 745-754, 2009

• Кокоза ЕБ, Колесникова ТД, Зыков ИА, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Обратимая деконденсация гетерохроматиновых районов политенных хромосом D. melanogaster при эктопической экспрессии гена SuUR. Доклады Академии наук 425: 421-423, 2009

• Колесникова ТД, Демаков СА, Иванкин АВ, Андреенкова НГ, Жимулев ИФ. Скорость движения репликационных вилок в политенных хромосомах слюнных желез Drosophila melanogaster не зависит от мутации Suppressor of UnderReplication. Доклады Академии наук 427: 122-125, 2009

• Мордвинов ВА, Марданов АВ, Равин НВ, Шеховцов СВ, Демаков СА, Катохин АВ, Колчанов НА, Скрябин КГ. Определение полной нуклеотидной последовательности митохондриального генома возбудителя описторхоза, Opisthorchis felineus . Acta Naturae 1: 99-104, 2009

2008

• Belyaeva ES, Andreyeva EN, Belyakin SN, Volkova EI, Zhimulev IF. Intercalary heterochromatin in polytene chromosomes of Drosophila melanogaster. Chromosoma 117: 411-418, 2008

• Semeshin VF, Demakov SA, Shloma VV, Vatolina TY, Gorchakov AA, Zhimulev IF. Interbands behave as decompacted autonomous units in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Genetica 132: 267-279, 2008

• Pindyurin AV, Boldyreva LV, Shloma VV, Kolesnikova TD, Pokholkova GV, Andreyeva EN, Kozhevnikova EN, Ivanoschuk IG, Zarutskaya EA, Demakov SA, Gorchakov AA, Belyaeva ES, Zhimulev IF. Interaction between the Drosophila heterochromatin proteins SUUR and HP1. J Cell Sci 121: 1693-1703, 2008

• Волкова ЕИ, Белякин СН, Беляева ЕС, Жимулев ИФ. Распределение разрывов индуцированных хромосомных перестроек по длине хромосом и проблема интеркалярного гетерохроматина Drosophila melanogaster. Генетика 44: 746-751, 2008

• Жимулёв ИФ, Беляева ЕС, Андреенкова НГ, Андреева ЕН, Белякин СН, Болдырева ЛВ, Брусенцова ИВ, Волкова ЕИ, Демаков СА, Демакова ОВ, Заруцкая ЕА, Зыков ИА, Кокоза ЕБ, Колесникова ТД, Комор УА, Коряков ДЕ, Макунин ИВ, Пиндюрин АВ, Похолкова ГВ, Семешин ВФ, Шлома ВВ, Юрлова АА. Ген SuUR – уникальный инструмент для изучения структуры и организации хромосом и генома дрозофилы. Информацинный Вестник ВОГиС 12(1/2): 127-149, 2008

2007

• Demakova OV, Pokholkova GV, Kolesnikova TD, Demakov SA, Andreyeva EN, Belyaeva ES, Zhimulev IF. The SU(VAR)3-9/HP1 complex differentially regulates the compaction state and degree of underreplication of X chromosome pericentric heterochromatin in Drosophila melanogaster. Genetics 175: 609-620, 2007