Публикации и материалы конференций Лаборатории цитогенетики животных

2022

  • Proskuryakova AA, Ivanova ES, Perelman PL, Ferguson-Smith MA, Yang F, Okhlopkov IM, Graphodatsky AS. Comparative studies of karyotypes in the Cervidae family. (doi: 10.1159/000527349) Cytogenet Genome Res 162(6): 312-322, 2022

  • Dumas F, Perelman PL, Biltueva L, Roelke M. Retrotransposon mapping in spider monkey genomes of the family Atelidae (Platyrrhini, Primates) shows a high level of LINE-1 amplification. (doi: 10.4081/jbr.2022.10725) J Biol Res 95(2): 10725, 2022

  • Interesova EA, Babkina IB, Romanov VI, Pozdnyak IV, Davletshina GI, Trifonov VA. New data on small lampreys of the genus Lethenteron (Petromyzontidae) of the Tom river, a typical habitat of the Siberian brook lamprey Lethenteron kessleri. (doi: 10.1134/S003294522206011X) J Ichthyol 62(7): 1230-1236, 2022

  • Tishakova KV, Prokopov DY, Davletshina GI, Rumyantsev AV, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M, Lisachov AP, Trifonov VA. Identification of Iguania ancestral syntenic blocks and putative sex chromosomes in the veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania). (doi: 10.3390/ijms232415838) Int J Mol Sci 23(24): 15838, 2022

  • Уфыркина ОВ, Беклемишева ВР, Гончарук МС, Керли Л, Графодатский АС, Перельман ПЛ. О необходимости внесения дальневосточного лесного кота Prionailurus bengalensis euptilura в Красные книги Приморского Края и Российской Федерации. (doi: 10.25221/2782-1978_2022_3_3) Биота и среда природных территорий 10(3): 21-35, 2022

  • Тиунов МП, Проскурякова АА, Батурина АК, Перельман ПЛ, Графодатский АС. Новый вид летучей мыши Eptesicus pachyomus (Chiroptera, Vespertilionidae) в фауне России. (doi: 10.31857/S004451342212011X) Зоологический журнал 101(12): 1424-1428, 2022

  • Romanenko SA, Prokopov DY, Proskuryakova AA, Davletshina GI, Tupikin AE, Kasai F, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with fluorescence in situ localization of major repetitive DNAs. (doi: 10.3390/ijms232113063) Int J Mol Sci 23(21): 13063, 2022

  • Romanenko S, Trifonov V. Chapter 3. Generation of microdissection-derived painting probes from single copy chromosomes. In: Liehr T (ed.) Cytogenetics and Molecular Cytogenetics, CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 2022, pp 27-34 (doi: 10.1201/9781003223658)

  • Milioto V, Perelman PL, Paglia LL, Biltueva L, Roelke M, Dumas F. Mapping retrotransposon LINE-1 sequences into two Cebidae species and Homo sapiens genomes and a short review on primates. (doi: 10.3390/genes13101742) Genes 13(10): 1742, 2022

  • de Ferran V, ..., Kliver S, Serdyukova N, ..., Eizirik E. Phylogenomics of the world’s otters. (doi: 10.1016/j.cub.2022.06.036) Curr Biol 32(16): 3650-3658.e4, 2022

  • Интересова ЕА, Романов ВИ, Давлетшина ГИ, Федорова ВС, Трифонов ВА. Расширение ареала вьюна Никольского Misgurnus nikolskyi (Cobitidae) на юге Западной Сибири. (doi: 10.35885/1996-1499-15-2-38-42) Российский журнал биологических инвазий 15(2): 38-42, 2022

  • Molodtseva AS, Makunin AI, Salomashkina VV, Kichigin IG, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Shunkov MV, Tishkin AA, Grushin SP, Anijalg P, Tammeleht E, Keis M, Boeskorov GG, Mamaev N, Okhlopkov IM, Kryukov AP, Lyapunova EA, Kholodova MV, Seryodkin IV, Saarma U, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Phylogeography of ancient and modern brown bears from eastern Eurasia. (doi: 10.1093/biolinnean/blac009) Biol J Linn Soc 135(4): 722-733, 2022

  • Suchan T, Kusliy MA, Khan N, Chauvey L, Tonasso-Calvière L, Schiavinato S, Southon J, Keller M, Kitagawa K, Krause J, Bessudnov AN, Bessudnov AA, Graphodatsky AS, Lamas SV, Wilczyński J, Pospuła S, Tunia K, Nowak M, Moskal-delHoyo M, Tishkin AA, Pryor AJ, Outram AK, Orlando L. Performance and automation of ancient DNA capture with RNA hyRAD probes. (doi: 10.1111/1755-0998.13518) Mol Ecol Resour 22(3): 891-907, 2022

  • Rajičić M, Makunin A, Adnađević T, Trifonov V, Vujošević M, Blagojević J. B chromosomes’ sequences in yellow-necked mice Apodemus flavicollis — exploring the transcription. (doi: 10.3390/life12010050) Life 12(1): 50, 2022

  • Трифонов ВА, Фофанов МВ. Паттерны редиплоидизации после полногеномных дупликаций у животных. Материалы Юбилейной научной конференции "Николай Константинович Кольцов и биология XXI века", М. Издательство Перо, 2022, 1.38 Мб [Электронное издание], ISBN 978-5-00204-554-9. с. 85

  • Fofanov MV, Prokopov DYu, Trifonov VA, Beklemisheva VR, Khan R, Aiden E, Graphodatsky AS, Perelman PL. Comparative bioinformatic analysis of Hi-C chromosome-level scaffolds and chromosome painting maps of Vulpes vulpes and Canis familiaris (Canidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 113-114

  • Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Prokopov DYu, Romanenko SA, Serdyukova NA, Utkin YaA, Graphodatsky AS. Detailed analysis of distribution of repetitive sequences across genomes of Martes (Mustelidae, Carnivora, Mammalia). The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 137-138

  • Proskuryakova AA. Chromosome evolution in Ruminantia. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 165

  • Romanenko SA, Proskuryakova AA, Prokopov DYu, Davletshina GI, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. The cytogenetic map of the Nile crocodile (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia) with in situ localization of major tandemly arranged repetitive DNAs. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 167-168

  • Tishakova K, Prokopov D, Davletshina G, O’Brien P, Ferguson-Smith M, Giovannotti M, Trifonov V. Composition of sex chromosomes of veiled chameleon (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Squamata) reveals new insights into sex chromosome evolution of iguanian lizards. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 179

  • Minina JM, Karamysheva TV, Serdyukova NA, Serov OL. Quantitative estimation of trisomy on chromosome 6 in embryonic fibroblasts of mice carrying duplications obtained using CRISPR/Cas9 technology. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 672-673

  • Buggiotti L, Romashov G, Yurchenko A, Yudin NS, Zinovieva NA, Graphodatsky A, Larkin D. Does an extreme climate make domestic and wild animals evolve similarly? #43462, Abstract book. XXIX Conference "Plant and Animal Genome", January 8-12, 2022, San Diego, CA, USA

2021

  • Ceraulo S, Perelman PL, Dumas F. Massive LINE-1 retrotransposon enrichment in tamarins of the Cebidae family (Platyrrhini, Primates) and its significance for genome evolution. (doi: 10.1111/jzs.12536) J Zool Syst Evol Res 59(8): 2553-2561, 2021 

  • Beklemisheva VR, Belokopytova PS, Fishman VS, Menzorov AG. Derivation of ringed seal (Phoca hispida) induced multipotent stem cells. (doi: 10.1089/cell.2021.0037) Cell Reprogram 23(6): 326-335, 2021

  • Gridina MM, Shitik EM, Lemskaya NA, Minina JM, Grishchenko IV, Dolskiy AA, Shorina AR, Maksimova YV, Yudkin DV. Derivation of iPS cell line (ICGi032-A) from a patient affected with fragile X syndrome. (doi: 10.1016/j.scr.2021.102615) Stem Cell Res 57: 102615, 2021

  • Никитин СВ, Князев СП, Трифонов ВА, Проскурякова АА, Шмидт ЮД, Шатохин КС, Запорожец ВИ, Башур ДС, Коршунова ЕВ, Ермолаев ВИ. Необычная врожденная полидактилия мини-свиней селекционной группы ИЦиГ СО РАН. (doi: 10.18699/VJ21.074) Вавиловский журнал генетики и селекции 25(6): 652-660, 2021

  • Tamazian G, Dobrynin P, Zhuk A, Zhernakova DV, Perelman PL, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Komissarov A, Kliver S, Cherkasov N, Scott AF, Mohr DW, Koepfli K-P, O’Brien SJ, Krasheninnikova K. Draft de novo genome assembly of the elusive jaguarundi, Puma yagouaroundi. (doi: 10.1093/jhered/esab036) J Heredity 112(6): 540-548, 2021

  • Librado P, ... Kusliy MA, ... Graphodatsky AS, ... Orlando L. The origins and spread of domestic horses from the Western Eurasian steppes. (doi: 10.1038/s41586-021-04018-9) Nature 598: 634-640, 2021

  • Lemskaya NA, Romanenko SA, Rezakova MA, Filimonova EA, Prokopov DY, Dolskiy AA, Perelman PL, Maksimova YV, Shorina AR, Yudkin DV. A rare familial rearrangement of chromosomes 9 and 15 associated with intellectual disability: a clinical and molecular study. (doi: 10.1186/s13039-021-00565-y) Mol Cytogenet 14: 47, 2021

  • Ceraulo S, Perelman PL, Mazzoleni S, Rovatsos M, Dumas F. Repetitive sequence distribution on Saguinus, Leontocebus and Leontopithecus tamarins (Platyrrhine, Primates) by mapping telomeric (TTAGGG) motifs and rDNA loci. (doi: 10.3390/biology10090844) Biology 10(9): 844, 2021

  • Totikov A, Tomarovsky A, Prokopov D, Yakupova A, Bulyonkova T, Derezanin L, Rasskazov D, Wolfsberger WW, Koepfli K-P, Oleksyk TK, Kliver S. Chromosome-level genome assemblies expand capabilities of genomics for conservation biology. (doi: 10.3390/genes12091336) Genes 12(9): 1336, 2021

  • Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 193-209 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O’Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Comparative chromosome mapping of musk ox and the X chromosome among some bovidae species. In: Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M (eds) Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture, MDPI, Switzerland, 2021, pp 211-224 (doi: 10.3390/books978-3-0365-0157-4)

  • Buggiotti L, Yurchenko AA, Yudin NS, Vander Jagt CJ, Vorobieva NV, Kusliy MA, Vasiliev SK, Rodionov AN, Boronetskaya OI, Zinovieva NA, Graphodatsky AS, Daetwyler HD, Larkin DM. Demographic history, adaptation, and NRAP convergent evolution at amino acid residue 100 in the world northernmost cattle from Siberia. (doi: 10.1093/molbev/msab078) Mol Biol Evol 38(8): 3093-3110, 2021

  • Lisachov AP, Tishakova KV, Romanenko SA, Molodtseva AS, Prokopov DYu, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Whole-chromosome fusions in the karyotype evolution of Sceloporus (Iguania, Reptilia) are more frequent in sex chromosomes than autosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0099) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1833): 20200099, 2021

  • Kuhl H, ... Prokopov D, ... Stöck M. A 180 Myr-old female-specific genome region in sturgeon reveals the oldest known vertebrate sex determining system with undifferentiated sex chromosomes. (doi: 10.1098/rstb.2020.0089) Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 376(1832): 20200089, 2021

  • Karamysheva T, Romanenko S, Makunin A, Rajičić M, Bogdanov A, Trifonov V, Blagojević J, Vujošević M, Orishchenko K, Rubtsov N. New data on organization and spatial localization of B-chromosomes in cell nuclei of the yellow-necked mouse Apodemus flavicollis. (doi: 10.3390/cells10071819) Cells 10(7): 1819, 2021

  • Romanenko SA, Malikov VG, Mahmoudi A, Golenishchev FN, Lemskaya NA, Pereira JC, Trifonov VA, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Aliabadian M, Graphodatsky AS. New data on comparative cytogenetics of the mouse-like hamsters (Calomyscus Thomas, 1905) from Iran and Turkmenistan. (doi: 10.3390/genes12070964) Genes 12(7): 964, 2021

  • Höhne C, Prokopov D, Kuhl H, Du K, Klopp C, Wuertz S, Trifonov V, Stöck M. The immune system of sturgeons and paddlefish (Acipenseriformes): a review with new data from a chromosome‐scale sturgeon genome. (doi: org/10.1111/raq.12542) Rev Aquacult 13(3): 1709-1729, 2021

  • Lisachov A, Andreyushkova D, Davletshina G, Prokopov D, Romanenko S, Galkina S, Saifitdinova A, Simonov E, Borodin P, Trifonov V. Amplified fragments of an autosome-borne gene constitute a significant component of the W sex chromosome of Eremias velox (Reptilia, Lacertidae). (doi: 10.3390/genes12050779) Genes 12(5): 779, 2021

  • Romanenko SA, Lebedev VS, Bannikova AA, Pavlova SV, Serdyukova NA, Feoktistova NYu, Jiapeng Q, Yuehua S, Surov AV, Graphodatsky AS. Karyotypic and molecular evidence supports the endemic Tibetan hamsters as a separate divergent lineage of Cricetinae. (doi: 10.1038/s41598-021-89890-1) Sci Rep 11: 10557, 2021

  • Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Molodtseva AS, Perelman PL, Interesova EA, Beklemisheva VR, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolution of tandemly arranged repetitive DNAs in three species of Cyprinoidei with different ploidy levels. (doi: 10.1159/000513274) Cytogenet Genome Res 161: 32-42, 2021

  • Mordvinov VA, Minkova GA, Kovner AV, Ponomarev DV, Lvova MN, Zaparina O, Romanenko SA, Shilov AG, Pakharukova MY. A tumorigenic cell line derived from a hamster cholangiocarcinoma associated with Opisthorchis felineus liver fluke infection. (doi: 10.1016/j.lfs.2021.119494) Life Sci 277: 119494, 2021

  • Lemskaya NA, Romanenko SA, Maksimova YV, Shorina AR, Yudkin DV. Identification of satellited markers by microdissection and fluorescence in situ hybridization: a clinical case of isodicentric chromosome 22. (doi: 10.1186/s43042-021-00146-z) Egypt J Med Hum Genet 22: 24, 2021

  • Трифонов ВА Шаймуратова ДН, Асылгараева ГШ, Монахов СП, Молодцева АС, Аськеев АО, Аськеев ИВ, Аськеев ОВ. Археогеномика доместикации животных Евразии. (doi: 10.24852/pa2021.1.35.179.186) Поволжская Археология 1(35): 179-186, 2021

  • Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron age mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. In: 

    eds. Caramelli D, Lari M, Vai S (eds) Ancient and Archaic Genomes, MDPI, Switzerland, 2021, pp 5-19

  • Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron Age Mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. (doi: 10.3390/genes12030412) Genes 12(3): 412, 2021

  • Побединцева МА, Решетникова СН, Сердюкова НА, Бишани А, Трифонов ВА, Интересова ЕА. Генетическая гетерогенность серебряного карася Carassius gibelio (Cyprinidae) в бассйне средней Оби. (doi: 10.31857/S0016675821040111) Генетика 57(4): 429-436, 2021

  • Evdokimov A., Popov A., Ryabchikova E., Koval O., Romanenko S., Trifonov V., Petruseva I., Lavrik I., Lavrik O. Uncovering molecular mechanisms of regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.18632/aging.202577) Aging (Albany NY) 13(3): 3239-3253, 2021

  • Iannucci A, Makunin AI, Lisachov AP, Ciofi C, Stanyon R, Svartman M, Trifonov VA. Bridging the gap between vertebrate cytogenetics and genomics with single-chromosome sequencing (ChromSeq). (doi: 10.3390/genes12010124) Genes 12(1): 124, 2021

  • Dolskiy AA, Yarushkin AA, Grishchenko IV, Lemskaya NA, Pindyurin AV, Boldyreva LV, Pustylnyak VO, Yudkin DV. miRNA expression and interaction with the 3′UTR of FMR1 in FRAXopathy pathogenesis. (doi: 10.1016/j.ncrna.2020.11.006) Non-coding RNA Res 6(1): 1-7, 2021

  • Куслий МА, Тишкин АА, Воробьева НВ, Семибратов ВП, Кирюшин КЮ, Ковалев АА, Эрдэнэбаатар Д, Графодатский АС. Палеогенетические определения мастей и пола у лошадей из древних памятников Алтая. С. 323-328. В кн.: Материалы XI Международной научной конференции "Древние культуры Монголии, Южной Сибири и Северного Китая" (doi: 10.31600/978-5-907298-19-4.323-328). Абакан, 2021

  • Popov A, Evdokimov A, Ryabchikova E, Koval O, Romanenko S, Trifonov V, Petruseva I, Lavrik I, Lavrik O. Regulated cell death in the naked mole rat. (doi: 10.1002/2211-5463.13205) FEBS Open Bio 11(Suppl. 1): 466 (P-08.4-13), 2021

2020

  • Абакумов ЕВ, Лойко СВ, Истигечев ГИ, Кулемзина АИ, Лащинский НН, Андронов ЕЕ, Лапидус АЛ. Почвы черневой тайги Западной Сибири — морфология, агрохимические особенности, микробиота. (doi: 10.15389/agrobiology.2020.5.1018rus) Сельскохозяйственная биология 55(5): 1018-1039, 2020

  • Mamani C, Gutiérrez Reynoso GA, Perelman P, Johnson WE, de León Bravo FAP. Use of the high-density bovine microarray for the generation of an alpaca (Vicugna pacos) single nucleotide polymorphism physical map. (doi: 10.15381/RIVEP.V31I3.18725) Revista de Investigaciones Veterinarias del Peru 31(3): e18725, 2020

  • Fofanov MV, Prokopov DY, Kuhl H, Schartl M, Trifonov VA. Evolution of microRNA biogenesis genes in the sterlet (Acipenser ruthenus) and other polyploid vertebrates. (doi: 10.3390/ijms21249562) Int J Mol Sci 21(24): 9562, 2020

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Burkanov VN, Gorshunov MB, Ryder O, Thompson M, Lento G, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Karyotype evolution in 10 pinniped species: variability of heterochromatin versus high conservatism of euchromatin as revealed by comparative molecular cytogenetics. (doi: 10.3390/genes11121485) Genes 11(12): 1485, 2020

  • Biltueva LS, Prokopov DY, Romanenko SA, Interesova EA, Schartl M, Trifonov VA. Chromosome distribution of highly conserved tandemly arranged repetitive DNAs in the Siberian sturgeon (Acipenser baerii). (doi: 10.3390/genes11111375) Genes 11(11): 1375, 2020

  • Vorobieva NV, Makunin AI, Druzhkova AS, Kusliy MA, Trifonov VA, Popova KO, Polosmak NV, Molodin VI, Vasiliev SK, Shunkov MV, Graphodatsky AS. High genetic diversity of ancient horses from the Ukok Plateau. (doi: 10.1371/journal.pone.0241997) PLoS ONE 15(11): e0241997, 2020

  • Gridina MM, Orlova PA, Minina JM, Shitik EM, Lemskaya NA, Grishchenko IV, Dolskiy AA, Shorina AR, Maksimova YV, Yudkin DV, Serov OL. Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi026-A) from peripheral blood mononuclear cells of a patient with fragile X syndrome. (doi: 10.1016/j.scr.2020.102070) Stem Cell Res 49: 102070, 2020

  • Графодатский АС. Разнообразие и эволюция геномов. (doi: 10.22204/2410-4639-2020-106-02-38-49) Вестник РФФИ 2(106): 38-49, 2020

  • Romanenko SA, Fedorova YuE, Serdyukova NA, Zaccaroni M, Stanyon  R, Graphodatsky AS. Evolutionary rearrangements of X chromosomes in voles (Arvicolinae, Rodentia). (doi: 10.1038/s41598-020-70226-4) Sci Reports 10: 13235, 2020

  • Kolesnikova TD, Kolodyazhnaya AV, Pokholkova GV, Schubert V, Dovgan VV, Romanenko SA, Prokopov DYu, Zhimulev IF. Effects of mutations in the Drosophila melanogaster Rif1 gene on the replication and underreplication of pericentromeric heterochromatin in salivary gland polytene chromosomes. (doi: 10.3390/cells9061501) Cells 9(6): 1501, 2020 

  • Du K, … Prokopov D, Makunin A, Kichigin I, … Trifonov V, … Schartl M. The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization. (doi: 10.1038/s41559-020-1166-x) Nat Ecol Evol 4: 841–852, 2020

  • Grishchenko IV, Purvinsh YV, Yudkin DV. Mystery of expansion: DNA metabolism and unstable repeats. In: Zharkov D. (eds) Mechanisms of Genome Protection and Repair. Advances in Experimental Medicine and Biology, vol 1241, 2020, pp 101-124 (doi: 10.1007/978-3-030-41283-8_7)

  • Yang C, Li F, Xiong Z, Koepfli K-P, Ryder O, Perelman P, Li Q, Zhang G. A draft genome assembly of spotted hyena, Crocuta crocuta. (doi: 10.1038/s41597-020-0468-9) Sci Data 7: 126, 2020

  • Lisachov AP, Giovannotti M, Pereira JC, Andreyushkova DA, Romanenko SA, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Chromosome painting does not support a sex chromosome turnover in Lacerta agilis Linnaeus, 1758. (doi: 10.1159/000506321) Cytogenet Genome Res 160: 134-140, 2020

  • Билтуева ЛС, Перельман ПЛ, Проскурякова АА, Лемская НА, Сердюкова НА, Графодатский АС. Хромосомы индийского мунтжака (Muntiacus muntjak). Возвращение. (doi: 10.31857/S0041377120050016) Цитология 62(5): 316–321, 2020

  • Atlas of mammalian chromosomes (2nd edition). eds. Graphodatsky AS, Perelman PL, O’Brien SJ. Wiley-Blackwell, USA, 2020, 1008 p

  • Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism.(doi: 10.3390/genes11040374) Genes 11(4): 374, 2020

  • Scardino R, Milioto V, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Perelman PL, Dumas F. Evolution of the human chromosome 13 synteny: evolutionary rearrangements, plasticity, human disease genes and cancer breakpoints. (doi: 10.3390/genes11040383) Genes 11(4): 383, 2020

  • Rayko M, Kulemzina A, Abakumov E, Istigechev G, Andronov E, Lashchinsky N, Lapidus A. Metagenomic analysis of the soil microbiota associated with plant gigantism of the unique Siberian Chernevaya Taiga. Selected abstracts of “Bioinformatics: from Algorithms to Applications 2020” conference. (doi: 10.1186/s12859-020-03838-2) BMC Bioinformatics 21(Suppl 20): P4, 2020 

  • Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторенной ДНК в геномах осетрообразных. Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов 2020", М.: МАКС Пресс, 2020, ISBN 978-5-317-06417-4

  • Tishakova K, Prokopov D, Kichigin I, Molodtseva A, Kratochvil L, Lisachov A, Trifonov V. Analysis of sequenced chromosome-specific libraries of gekkonids sheds light to large scale genome reshuffling in reptiles. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-164) Novosibirsk, 2020, p. 260

  • Popov A, Evdokimov A, Petruseva I, Romanenko S, Trifonov V, Koval O, Lavrik I, Ryabchikova E, Lavrik O. Regulated cell death in Hetherocephalus glaber. The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-365) Novosibirsk, 2020, p. 597

  • Davletshina G, Kliver S, Prokopov D, Interesova E, Trifonov V. Application of ITS1 and ITS2 for population genetic studies of sturgeons (Acipenseridae). The Twelfth International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure (BGRS/SB-2020). Abstracts book. (doi: 10.18699/BGRS/SB-2020-133) Novosibirsk, 2020, p. 209

  • Куслий МА, Хан Н, Тишкин АА, Кирюши КЮ, Фаж А, Воробьева НВ, Графодатский АС, Орландо Л. Предварительные результаты молекулярно-генетического анализа остеологических материалов от древних лошадей из поселений Новоильинеп-III и VI (Кулундинская степь). Труды VI (XXII) Всероссийского археологического съезда в Самаре. В 3-х томах. Том. III. с. 253-255. Самара, 2020, ISBN: 978-5-8428-1171-7

  • Куслий МА, ..., Графодатский АС, Орландо Л. Предварительный анализ древней ДНК 170 остеологических образцов от лошадей, обитавших в Азии. C. 182-187. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  • Куслий МА, Тишкин АА, Фаж А, Либрадо П, Хан Н, Боковенко НА, Идэрхангай Т-О, Чугунов КВ, Графодатский АС, Орландо Л. Особенности селекции лошадей в аржано-майэмирское время на Алтае, в  Туве И Монголии. C. 188-192. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

  • Воробьева НВ, Куслий МА, Дружкова АС, Макунин АИ, Попова КО, Трифонов ВА, Графодатский АС, Васильев СК, Полосьмак НВ, Молодин ВИ. Филогеография древних лошадей из курганов плато Укок. C. 232-235. В кн.: Экология древних и традиционных обществ. Материалы VI Международной научной конференции (ISBN 978-5-89181-072-3) (doi: 10.20874/978-5-89181-072-3). Тюмень: Изд-во ТюмНЦ СО РАН, 2020. Вып 6. 438 с. 

2019

  • Графодатский АС, Трифонов ВА. Родиться баобабом. Наука из первых рук 85(5/6): 16-31, 2019

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O’Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Comparative chromosome mapping of musk ox and the X chromosome among some bovidae species. (doi: 10.3390/genes10110857) Genes 10(11): 857, 2019

  • Tchurikov NA, Kretova OV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Grachev SA, Serebraykova MV, Romanenko SA, Vorobieva NV, Kravatsky YuV. DNA double-strand breaks coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 binding sites flank coordinately expressed domains in human chromosomes. Chapter 10 in Top 10 Contributions on Genetics. 2nd ed. Avid Science, India. 2019

  • Romanenko SA, Lyapunova EA, Saidov AS, O’Brien PCM, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Bakloushinskaya I. Chromosome translocations as a driver of diversification in mole voles Ellobius (Rodentia, Mammalia). (doi: 10.3390/ijms20184466) Int J Mol Sci 20(18): 4466, 2019

  • Картавцева ИВ, Васильева ТВ, Шереметьева ИН, Лемская НА, Моролдоев ИВ, Голенищев ФН. Генетическая изменчивость трех изолированных популяций Муйской полевки Alexandromys mujanensis Orlov et Kovalskaja, 1978 (Rodentia, Arvicolinae). (doi: 10.1134/S0016675819080071) Генетика 55(8): 920-935, 2019

  • Lewin HA, Graves JAM, Ryder OA, Graphodatsky AS, O'Brien SJ. Precision nomenclature for the new genomics. (doi: 10.1093/gigascience/giz086) GigaScience 8(8): giz086, 2019

  • Farré M, Li Q, Darolti I, Zhou Y, Damas J, Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Chemnick LG, Kim J, Ryder OA, Ma J, Graphodatsky AS, Zhang G, Larkin DM, Lewin HA. An integrated chromosome-scale genome assembly of the Masai giraffe (Giraffa camelopardalis tippelskirchi). (doi: 10.1093/gigascience/giz090) GigaScience 8(8): giz090, 2019

  • Lind AL,... Kichigin IG, Makunin AI,... Trifonov VA,... Bruneau BG. Genome of the Komodo dragon reveals adaptations in the cardiovascular and chemosensory systems of monitor lizards. (doi: 10.1038/s41559-019-0945-8) Nature Ecol Evol 3 (8): 1241-1252, 2019

  • Lisachov AP, Makunin AI, Giovannotti M, Pereira JC, Druzhkova AS, Barucchi VC, Ferguson-Smith MA, Trifonov VA. Genetic content of the neo-sex chromosomes in Ctenonotus and Norops (Squamata, Dactyloidae) and degeneration of the Y chromosome as revealed by high-throughput sequencing of individual chromosomes. (doi: 10.1159/000497091) Cytogenet Genome Res 157(1-2): 115-122, 2019

  • Bakloushinskaya I, Lyapunova EA, Saidov AS, Romanenko SA, O'Brien PCM, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Matveevsky S, Bogdanov AS. Rapid chromosomal evolution in enigmatic mammal with XX in both sexes, the Alay mole vole Ellobius alaicus Vorontsov et al., 1969 (Mammalia, Rodentia). (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i2.34224) Comp Cytogenet 13(2): 147-177, 2019

  • Richardson MF, Munyard K, Croft LJ, Allnutt TR, Jackling F, Alshanbari F, Jevit M, Wright GA, Cransberg R, Tibary A, Perelman P, Appleton B, Raudsepp T. Chromosome-level alpaca reference genome VicPac3.1 improves genomic insight into the biology of New World camelids. (doi: 10.3389/fgene.2019.00586) Front Genet 10: 586, 2019

  • Elbers JP, Rogers MF, Perelman PL, Proskuryakova AA, Serdyukova NA, Johnson WE, Horin P, Corander J, Murphy D, Burger PA. Improving Illumina assemblies with Hi‐C and long reads: an example with the North African dromedary. (doi: 10.1111/1755-0998.13020) Mol Ecol Resour 19(4): 1015-1026, 2019

  • Kosova AA, Kutuzov MM, Evdokimov AN, Ilina ES, Belousova EA, Romanenko SA, Trifonov VA, Khodyreva SN, Lavrik OI. Poly(ADP-ribosyl)ation and DNA repair synthesis in the extracts of naked mole rat, mouse, and human cells. (doi: 10.18632/aging.101959) Aging 11(9): 2852-2873, 2019

  • Lisachov AP, Galkina SA, Saifitdinova AF, Romanenko SA, Andreyushkova DA, Trifonov VA, Borodin PM. Identification of sex chromosomes in Eremias velox (Lacertidae, Reptilia) using lampbrush chromosome analysis. (doi: 10.3897/CompCytogen.v13i2.34116) Comp Cytogenet 13(2): 121-132, 2019

  • Farré M, Kim J, Proskuryakova AA, Zhang Y, Kulemzina AI, Li Q, Zhou Y, Xiong Y, Johnson JL, Perelman P, Johnson WE, Warren WC, Kukekova AV, Zhang G, O'Brien SJ, Ryder OA, Graphodatsky AS, Ma J, Lewin HA, Larkin DM. Evolution of gene regulation in ruminants differs between evolutionary breakpoint regions and homologous synteny blocks. (doi: 10.1101/gr.239863.118) Genome Res 29(4): 576-589, 2019

  • Kichigin IG, Lisachov AP, Giovannotti M, Makunin AI, Kabilov MR, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MF, Graphodatsky AS, Trifonov VA. First report on B chromosome content in a reptilian species: the case of Anolis carolinensis. (doi: 10.1007/s00438-018-1483-9) Mol Genet Genomics 294(1): 13-21, 2019 

  • Pobedintseva MA, Makunin AI, Kichigin IG, Kulemzina AI, Serdyukova NA, Romanenko SA, Vorobieva NV, Interesova EA, Korentovich MA, Zaytsev VF, Mischenko AV, Zadelenov VA, Yurchenko AA, Sherbakov DYu, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Population genetic structure and phylogeography of sterlet (Acipenser ruthenus, Acipenseridae) in the Ob and Yenisei river basins. (doi: 10.1080/24701394.2018.1467409) Mitochondrial DNA Part A 30(1): 156-164, 2019

  • Andreyushkova DA, Lisachov AP, Romanenko SA, Giovannotti M, Pereira JC, Ferguson-Smith MA, Borodin PM, Trifonov VA. Investigation of Lacerta agilis sex chromosomes origin using Lacerta strigata flow-sorted fluorescence probes. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 21-22

  • Biltueva LS, Prokopov DYu, Romanenko SA, Schartl Manfred, Trifonov VA. Chromosomal organization and physical mapping of Siberian sturgeon genome (Acipenser baerii). International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 24

  • Bishani A, Prokopov DYu, Romanenko SA, Druzhkova AS, Interesova EA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Repetitive DNA characterization in cyprinid species with different ploidy level. International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 25

  • Tishakova KV, Lisachov AP, Galkina SA, Saifitdinova AF, Romanenko SA, Andreyushkova DA, Davletshina GI, Trifonov VA. An autosome-borne gene is extensively amplified in the W chromosome of Eremias velox (Lacertidae, Reptilia). International mini-conference "Chromosomes and Mitosis - 2019". Abstracts book (ISBN 978-5-4437-0971-0). Novosibirsk, 2019. p. 34-35

  • Лемская НА, Романенко СА, Дольский АА, Прокопов ДЮ, Шорина АР, Максимова ЮВ. Методы молекулярной цитогенетики в описании кариотипической патологии. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 805

  • Мензоров АГ, Беклемишева ВР. Сравнительный анализ трансдукции фибробластов ластоногих интегративными и неинтегративными вирусными векторами. VII съезд ВОГиС. Сборник тезисов. С-Пб: ООО Издательство ВВМ, 2019. ISBN 978-5-9651-1237-1. с. 970

  • Прокопов ДЮ. Разнообразие и эволюция повторённой ДНК в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов-2019". М: МАКС Пресс, 2019. ISBN 978‐5‐317‐06100‐5

  • Кичигин ИГ. Изучение генетического состава половых и добавочных хромосом чешуйчатых (Squamata, Reptilia) с помощью секвенирования изолированных хромосом. Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов-2019". М: МАКС Пресс, 2019. ISBN 978‐5‐317‐06100‐5

2018

  • Lemskaya NA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR,  Biltueva LS, Proskuryakova AA,  Hallenbeck JM, Perelman PP, Graphodatsky AS. A combined banding method that allows the reliable identification of chromosomes as well as differentiation of AT- and GC-rich heterochromatin. (doi: 10.1007/s10577-018-9589-9) Chromosome Res 26(4): 307-315, 2018

  • Беклемишева ВР, Мензоров АГ. Использование вектора на основе вируса Сендай для эффективной трансдукции фибробластов ластоногих. (doi: 10.18699/VJ18.445) Вавиловский журнал генетики и селекции 22(8): 1020-1025, 2018

  • Телепова АС, Романенко СА, Лемская НА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Юдкин ДВ. Маркерная хромосома, несущая гены рРНК, сопряженная с интеллектуальной недостаточностью: клинический случай. (doi: 10.17116/molgen201836041199) Молекулярная генетика, микробиология и вирусология 36(4): 199-202, 2018

  • Romanenko S, Serdyukova N, Perelman P, Trifonov V, Golenishchev F, Bulatova N, Stanyon R, Graphodatsky A. Multiple intrasyntenic rearrangements and rapid speciation in voles. (doi: 10.1038/s41598-018-33300-6) Sci Reports 8: 14980, 2018

  • Komissarov A, Vij S, Yurchenko A, Trifonov V, Thevasagayam N, Saju J, Sridatta PSR, Purushothaman K, Graphodatsky A, Orbán L, Kuznetsova I. B chromosomes of the Asian seabass (Lates calcarifer) contribute to genome variations at the level of individuals and populations. (doi: 10.3390/genes9100464) Genes 9(10): 464, 2018 

  • Pavlova SV, Biltueva LS, Romanenko SA, Lemskaya NA, Shchinov AV, Abramov AV, Rozhnov VV. First cytogenetic analysis of lesser gymnures (Mammalia, Galericidae, Hylomys) from Vietnam. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27207) Comp Cytogenet 12(3): 361-372, 2018

  • Kukekova AV,... Serdyukova NA,... Beklemischeva V,... Perelman PL, Graphodatsky AS,... Zhang G. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviours. (doi: 10.1038/s41559-018-0611-6) Nature Ecol Evol 2: 1479-1491, 2018 

  • Makunin AI, Romanenko SA, Beklemisheva VR, Perelman PL, Druzhkova AS, Petrova KO, Prokopov DY, Chernyaeva EN, Johnson JL, Kukekova AV, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Sequencing of supernumerary chromosomes of red fox and raccoon dog confirms a non-random gene acquisition by B chromosomes. (doi: 10.3390/genes9080405) Genes 9(8): 405, 2018

  • Makunin AI, Rajičić M, Karamysheva TV, Romanenko SA, Druzhkova AS, Blagojević J, Vujošević M, Rubtsov NB, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Low-pass single-chromosome sequencing of human small supernumerary marker chromosomes (sSMCs) and Apodemus B chromosomes. (doi: 10.1007/s00412-018-0662-0) Chromosoma 127(3): 301–311, 2018

  • Evdokimov A, Kutuzov M, Petruseva I, Lukjanchikova N, Kashina E, Kolova E, Zemerova T, Romanenko S, Perelman P, Prokopov D, Seluanov A, Gorbunova V, Graphodatsky A, Trifonov V, Khodyreva S, Lavrik O. Naked mole rat cells display more efficient excision repair than mouse cells. (doi: 10.18632/aging.101482) Aging (Albany NY) 10: 1454-1473, 2018

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Serdukova NA, Ryder OA, Graphodatsky AS. The case of X and Y localization of nucleolus organizer regions (NORs) in Tragulus javanicus (Cetartiodactyla, Mammalia). (doi: 10.3390/genes9060312) Genes 9(6): 312, 2018

  • Guselnikov SV, Baranov KO, Najakshin AM, Mechetina LV, Chikaev NA, Makunin AI, Kulemzin SV, Andreyushkova DA, Stöck M, Wuertz S, Gessner J, Warren WC, Schartl M,  Trifonov VA, Taranin AV. Diversity of immunoglobulin light chain genes in non-teleost ray-finned fish uncovers IgL subdivision into five ancient isotypes. (doi: 10.3389/fimmu.2018.01079) Front Immunol 9: 1079, 2018

  • Колесникова ИС, Тулупов АА, Дольский АА, Лемская НА, Савелов АА, Петровский ЕД, Антонов АА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Сергеева ИГ, Телепова АС, Графодатский АС, Юдкин ДВ. Повышенная экспрессия рРНК у пациента с интеллектуальной недостаточностью и семейным случаем хромосомы 13р+. Бюллетень сибирской медицины 17(1): 243-253, 2018

  • Bikchurina TI, Tishakova KV, Kizilova EA, Romanenko SA, Serdyukova NA, Torgasheva AA, Borodin PM. Chromosome synapsis and recombination in male-sterile and female-fertile interspecies hybrids of the dwarf hamsters (Phodopus, Cricetidae). (doi:10.3390/genes9050227) Genes 9(5): 227, 2018

  • Kolesnikova IS, Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Graphodatsky AS, Galanina EM, Yudkin DV. Alteration of rRNA gene copy number and expression in patients with intellectual disability and heteromorphic acrocentric chromosomes. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.08.010) Egypt J Med Hum Genet 19(2): 129-134, 2018

  • Teeling EC, Vernes SC, Dávalos LM, Ray DA, Gilbert MTP, Myers E, Bat1K Consortium [includes Graphodatsky AS]. Bat biology, genomes, and the Bat1K Project: to generate chromosome-level genomes for all living bat species. (doi: 10.1146/annurev-animal-022516-022811) Annu Rev Anim Biosci 6: 23-46, 2018

  • Capozzi O, Stanyon R, Archidiacono N, Ishida T, Romanenko SA, Rocchi M. Rapid emergence of independent “chromosomal lineages” in silvered-leaf monkey triggered by Y/autosome translocation. (doi: 10.1038/s41598-018-21509-4) Sci Reports 8: 3250, 2018

  • Perelman PL, Pichler R, Gaggl A, Larkin DM, Raudsepp T, Alshanbari F, Holl HM, Brooks SA, Burger PA, Periasamy K. Construction of two whole genome radiation hybrid panels for dromedary (Camelus dromedarius): 5000RAD and 15000RAD. (doi: 10.1038/s41598-018-20223-5) Sci Reports 8: 1982, 2018

  • Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Kolesnikova IS, Yudkin DV. Robertsonian translocation 13/14 associated with rRNA genes overexpression and intellectual disability. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.11.002) Egypt J Med Hum Genet 19(2): 141-145, 2018

  • Lemskaya NA. A modified protocol for highly efficient EBV-mediated immortalization of human B lymphocytes from small volumes of peripheral blood serum. (doi: 10.1016/j.ejmhg.2017.10.002) Egypt J Med Hum Genet 19(3): 221-223, 2018

  • Guselnikov S, Baranov K, Chikaev N, Najakshin A, Kulemzin S, Makunin A, Trifonov V, Taranin A. Mining of non-teleost fish transcriptomes and genomes uncovers the evolutionary history of Immunoglobulin light chains. Proceedings of the Eleventh international conference "Bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology" (BGRS\SB-2018), Novosibirsk, 2018, p. 44

  • Романенко СА, Федорова ЮЕ, Сердюкова НА, Графодатский АС. Внутрихромосомные перестройки в эволюционно консервативных синтенных блоках полевковых. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 168

  • Побединцева МА, Макунин АИ, Кичигин ИГ, Кулемзина АИ, Сердюкова НА, Романенко СА, Воробьева НВ, Интересова ЕА, Корентович МА, Зайцев ВФ, Мищенко АВ, Заделенов ВА, Юрченко АА, Щербаков ДЮ, Графодатский АС, Трифонов ВА. Популяционная генетика осетровых Сибири. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 156-157

  • Осипов ГВ, Васильев СК, Тиунов МП, Гимранов ДО, Уфыркина ОВ, Воробьева НВ, Дружкова АС, Графодатский АС. Выделение древней ДНК, секвенирование, генотипирование и видовая идентификация некоторых представителей древних кошачьих. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 152

  • Андреюшкова ДА, Макунин АИ, Романенко СА, Билтуева ЛС, Беклемишева ВР, Дружкова АС, Гусельников СВ, Сердюкова НА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Выявление паралогичных районов в геноме стерляди (Acipenser ruthenus). Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 93

  • Trifonov VA, Andreyushkova DA, Romanenko SA, Pobedintseva MA, Prokopov DYu, Biltueva LS, Beklemisheva VR, Druzhkova AS, Makunin AI, Graphodatsky AS. Polyploidy and genome evolution of ray-finned fishes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 81

  • Rando HM, Farré M, Johnson JL, Kim J, Zhang G, Perelman PL, Serdyukova NA, Kharlamova AV, Herbeck Yu, Gulevich RG, Vladimirova AV, Trut LN, Graphodatsky AS, O’Brien SJ, Larkin DM, Kukekova AV. Construction of red fox chromosomal fragments from the short-read genome assembly. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 67

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Larkin DM, Farre M, Kukekova AV, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Evolution of X chromosome in the order Cetartiodactyla. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 63

  • Makunin A. Summary of mammalian B chromosome sequencing. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 50

  • Makunin A. Using multiple reference genomes to identify phylogenetically informative markers for amplicon sequencing: an example from Anopheles mosquitoes. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 51

  • Kolesnikova IS, Dolskiy AA, Lemskaya NA, Maximova YuV, Shorina AR, Graphodatskiy AS, Yudkin DV. Altered rRNA levels in possible connection to intellectual disability. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 36-37

  • Kichigin IG, Makunin AI, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Studying iguanid and gekkonid sex chromosomes by isolated chromosome sequencing. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 33

  • Druzhkova AS, Makunin AI, Kichigin IG, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Shunkov MV, Tishkin AA, Grushin SP, Anijalg P, Tammeleht E, Keis M, Boeskorov G, Mamaev N, Ochlopkov I, Kryukov A, Lyapunova E, Kholodova M, Salomashkina V, Seryodkin I, Saarma U, Trifonov VA, Graphodatsky AS. The phylogeographical history of the brown bear (Ursus arctos Linnaeus) in Northeast Eurasia. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 18-19

  • Bernegossi AM, Silva DMZA, Tomazella IM, Trifonov VA, Romanenko SA, Serdukova NA, Duarte JMB. Generation of translocated chromosome probes of the Mazama gouazoubira species by microdissection. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 8-9

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. Pinniped karyotype evolution and Ancestral Carnivore Karyotype refinement revealed by comparative chromosome painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 5-6

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Proskuryakova AA, Romanenko SA, Prokopov DY, Luo S, Uphyrkina OV. Cytogenetic analyses of leopard cat subspecies (Prionailurus bengalensis) revealed Y-chromosome polymorphism. Материалы международной конференции "Хромосома 2018". Новосибирск, 2018. с. 4

  • Prokopov DY, Makunin AI, Biltueva LS, Komissarov AS, Sarachakov AE, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Identification and annotation of repetitive DNA in the genome of sterlet (Acipenser ruthenus). Bioinformatics: from algorithms to applications (16-19 July 2018, St Petersburg). Conference proceedings. p. 44-45

  • Прокопов ДЮ. Происхождение и эволюция половых и добавочных хромосом копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus). Материалы Международного молодежного научного форума "Ломоносов-2018". М.: МАКС Пресс, 2018. ISBN 978-5-317-05800-5

  • Trifonov VA, Lisachov AP, Kichigin IG, Makunin AI, Pereira JC, Druzhkova AS, Ferguson-Smith MA, Giovannotti M. Evolutionary sex chromosome translocations in amniotes. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748) Comp Cytogenet 12(3): 304-305, 2018

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, O'Brien SJ, Graphodatsky AS. Pinniped karyotype evolution substantiated by comparative chromo-some painting of 10 pinniped species (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748) Comp Cytogenet 12(3): 306-307, 2018

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Larkin DM, Farre M, Kukekova AV, Ryder OA, O'Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3897/CompCytogen.v12i3.27748) Comp Cytogenet 12(3): 307-308, 2018 

2017

  • Moskalev AА, Kudryavtseva AV, Graphodatsky AS, Beklemisheva VR, Serdyukova NA, Krutovsky KV, Sharov VV, Kulakovskiy IV, Lando AS, Kasianov AS, Kuzmin DA, Putintseva YuA, Feranchuk SI, Shaposhnikov MV, Fraifeld VE, Toren D, Snezhkina AV, Sitnik VV. De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. (doi: 10.1186/s12862-017-1103-z) BMC Evol Biol 17 (Suppl 2): 258, 2017

  • Telepova AS, Romanenko SA, Lemskaya NA, Maksimova YuV, Shorina AR, Yudkin DV. X-derived marker chromosome in patient with mosaic Turner syndrome and Dandy-Walker syndrome: a case report. (doi: 10.1186/s13039-017-0344-2) Mol Cytogenet 10: 43, 2017

  • Andreyushkova DA, Makunin AI, Beklemisheva VR, Romanenko SA, Druzhkova AS, Biltueva LB, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Next generation sequencing of chromosome-specific libraries sheds light on genome evolution in paleotetraploid sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.3390/genes8110318) Genes 8(11): 318, 2017

  • Biltueva LS, Prokopov DY, Makunin AI, Komissarov AS, Kudryavtseva AV, Lemskaya NA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Romanenko SA, Gladkikh OL, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Genomic organization and physical mapping of tandemly arranged repetitive DNAs in sterlet (Acipenser ruthenus). (doi: 10.1159/000479472) Cytogenet Genome Res 152: 148-157, 2017

  • Dymova MA, Zadorozhny AV, Mishukova OV, Khrapov EA, Druzhkova AS, Trifonov VA, Kichigin IG, Tishkin AA, Grushin SP, Filipenko ML. Mitochondrial DNA analysis of ancient sheep from Altai. (doi: 10.1111/age.12569) Anim Genet 48(5): 615-618, 2017

  • Romanenko SA, Serdyukova NA, Perelman PL, Pavlova SV, Bulatova NS, Golenishchev FN, Stanyon R, Graphodatsky AS. Intrachromosomal rearrangements in rodents from the perspective of comparative region-specific painting. (doi: 10.3390/genes8090215) Genes 8(9): 215, 2017

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Makunin AI, Larkin DM, Farré M, Kukekova AV, Johnson JL, Lemskaya NA, Beklemisheva VR, Roelke-Parker ME, Bellizzi J, Ryder OA, O’Brien SJ, Graphodatsky AS. X chromosome evolution in Cetartiodactyla. (doi: 10.3390/genes8090216) Genes 8(9): 216, 2017

  • Poplavskaya NS, Romanenko SA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Yang F, Nie W, Wang J, Bannikova AA, Surov AV, Lebedev VS. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of Cricetulus sokolovi Orlov et Malygin 1988 (Cricetidae, Rodentia) inferred from chromosomal painting and molecular data. (doi: 10.1159/000477521) Cytogenet Genome Res 152: 65-72, 2017

  • Chiatante G, Capozzi O, Svartman M, Perelman P, Centrone L, Romanenko S, Ishida T, Valeri M, Roelke-Parker ME, Stanyon R. Centromere repositioning explains fundamental number variability in the New World monkey genus Saimiri. (doi: 10.1007/s00412-016-0619-0) Chromosoma 126(4): 519-529, 2017

  • Rajičić M, Romanenko SA, Karamysheva TV, Blagojević J, Adnađević T, Budinski I, Bogdanov AS, Trifonov VA, Rubtsov NB, Vujošević M. The origin of B chromosomes in yellow-necked mice (Apodemus flavicollis) - Break rules but keep playing the game. (doi: 10.1371/journal.pone.0172704) PLoS ONE 12(3): e0172704, 2017

  • Dyomin AG, Danilova MI, Mwacharo JM, Masharsky AE, Panteleev AV, Druzhkova AS, Trifonov VA, Galkina SA. Mitochondrial DNA D-loop haplogroup contributions to the genetic diversity of East European domestic chickens from Russia. (doi: 10.1111/jbg.12248) J Anim Breed Genet 134(2): 98-108, 2017

  • Druzhkova AS, Makunin AI, Vorobieva NV, Vasiliev SK, Ovodov ND, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Complete mitochondrial genome of an extinct Equus (Sussemionus) ovodovi specimen from Denisova cave (Altai, Russia). (doi: 10.1080/23802359.2017.1285209) Mitochondrial DNA Part B 2(1): 79-81, 2017

  • Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Rens W. FISH with and without COT1 DNA. Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. (ed. T Liehr). 2nd ed. 606 p. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2017. pp. 123-132 (doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_11)

  • Yang F, Graphodatsky AS. Animal probes and ZOO-FISH. Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. (ed. T Liehr). 2nd ed. 606 p. Springer-Verlag Berlin Heidelberg. 2017. pp. 395-415 (doi: 10.1007/978-3-662-52959-1_42)

  • Колесникова ИС, Дольский АА, Лемская НА, Максимова ЮВ, Шорина АР, Телепова АС, Графодатский АС, Юдкин ДВ. Повышенная активность амплифицированных генов рибосомной РНК на хромосоме 13 у ребенка с умственной отсталостью: исследование семейного случая. Молекулярная диагностика 2017. Сборник трудов IХ Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. Москва, 2017. с. 76-77

  • Графодатский АС. Хромосомы и геномы домашних, пушных и промысловых млекопитающих. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 26

  • Kukekova AV, Johnson JL, Xiang X, Feng S, Liu S, Rando HM, Kharlamova AV, Herbeck Yu, Serdyukova NA, Xiong Z, Beklemisheva VR, Koepfli K-P, Gulevich RG, Vladimirova AV, Shepeleva DV, Hekman JP, Perelman PL, Graphodatsky AS, O’Brien SJ, Wang X, Clark AG, Acland GM, Zhang G, Trut LN. Red fox genome assembly identifies genomic regions associated with tame and aggressive behaviors. Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 43

  • Andreyushkova DA, Makunin AI, Beklemisheva VR, Romanenko SA, Druzhkova AS, Kulemzina AI, Biltueva LS, Serdyukova NA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Revealing of the chromosome synteny regions between sterlet (Acipenser ruthenus) and spotter gar (Lepisosteus oculatus). Беляевские чтения. Тезисы докладов Международной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения академика АН СССР Д.К. Беляева. Новосибирск, 2017. с. 113

  • Dolskiy AA, Pustylnyak VO, Yarushkin AA, Lemskaya NA, Yudkin DV. Inhibitors of histone deacetylases are weak activators of the FMR1 gene in Fragile X syndrome cell lines. (doi: 10.1155/2017/3582601) BioMed Res Int 2017: 3582601, 2017

  • Исанова ЕР, Петровский ЕД, Савелов АА, Юдкин ДВ, Лемская НА, Дольский АА, Тулупов АА. Исследование нейрональной активности головного мозга у пациентов с синдромом ломкой х-хромосомы методом функциональной МРТ. Rus Electron J Radiol (REJR) 7(3): 23-30, 2017

  • Бобокова ТС, Лемская НА, Колесникова ИС, Юдкин ДВ. Метод молекулярно-цитогенетической визуализации ломкого сайта FRAXA. (doi: 10.1134/S0026893317040069) Мол Биол 51(4): 704-709, 2017

  • Galanina EM, Tulupov AA, Lemskaya NA, Korostyshevskaya AM, Maksimova YV, Shorina AR, Savelov AA, Sergeeva IG, Isanova ER, Grishchenko IV, Yudkin DV. A female patient with FMR1 premutation and mosaic X chromosome aneuploidy and two sons with intellectual disability. (doi: 10.1159/000453060) Mol Syndromol 8: 110-114, 2017

  • Trifonov VA, Makunin AI, Romanenko SA, Biltueva LS, Beklemisheva VR, Pobedintseva MA, Prokopov DYu, Andreyushkova DA, Graphodatsky AS. Whole genome duplications in vertebrate evolution. Mol Cytogenet 10 (Suppl 1): 20(L17), 2017

  • Дружкова АС, Макунин АИ, Воробьева НВ, Васильев СК, Оводов НД, Шуньков МВ, Трифонов ВА, Графодатский АС. Сборка полного митохондриального генома лошади Оводов (Equus ovodovi) из Денисовой пещеры. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 71, 2017

  • Дружкова АС, Воробьева НВ, Макунин АИ, Васильев СК, Оводов НД, Тишкин АА, Трифонов ВА, Графодатский АС. Секвенирование митохондриальных геномов древних и современных представителей семейства медвежьи (Ursidae) Западной Сибири. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 71, 2017

  • Куслий МА, Дружкова АС, Воробьева НВ, Макунин АИ, Тишкин АА, Попова КО, Графодатский АС, Трифонов ВА, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование древнихлошадей археологического памятника Яломан-II. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 72, 2017

  • Попова КО, Воробьева НВ, Дружкова АС, Макунин АИ, Васильев СК, Оводов НД, Трифонов ВА, Графодатский АС. Изучение древней ДНК: митогеномы и В-хромосомы сибирской косули. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 72, 2017

  • Андреюшкова ДА, Макунин АИ, Беклемишева ВР, Романенко СА, Дружкова АС, Билтуева ЛС, Сердюкова НА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 75, 2017

  • Графодатский АС. Разнообразие геномов млекопитающих на хромосомном уровне. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 76, 2017 

  • Макунин АИ, Прокопов ДЮ, Кичигин ИГ, Дружкова АС, Графодатский АС, Трифонов ВА. Высокопроизводительное секвенированиеотдельных хромосом. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 78, 2017

  • Побединцева МА, Макунин АИ, Дружкова АС, Сердюкова НА, Воробьева НВ, Интересова ЕА, Графодатский АС, Трифонов ВА. Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальный геномов. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 78, 2017

  • Прокопов ДЮ, Макунин АИ, Романенко СА, Дружкова АС, Графодатский АС, Трифонов ВА. Изучение кариотипа копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом. Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 79, 2017

  • Трифонов ВА, Макунин АИ, Романенко СА, Беклемишева ВР, Билтуева ЛС, Прокопов ДЮ, Побединцева МА, Дружкова АС, Андреюшкова ДА, Гусельников СВ, Сердюкова НА, Кудрявцева АВ, Комиссаров АС, Кливер СФ, Шартл М, Графодатский АС. Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus). Acta Naturae 9 (Спецвыпуск 1): 80, 2017

2016

  • Галкина СА, Демин АГ, Пантелеев АВ, Дружкова АС, Трифонов ВА, Григорьева НВ. Перспективы и методика анализа ДНК ископаемых костей домашней курицы, обнаруженных при археологических раскопках. В кн. Ладога и проблемы древной и средневековой истории северной Евразии. СПб: Нестор-История, 2016. С. 118-124

  • Gladkikh OL, Romanenko SA, Lemskaya NA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Kovalskaya JM, Smorkatcheva AV, Golenishchev FN, Perelman PL, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Rapid karyotype evolution in Lasiopodomys involved at least two autosome – sex chromosome translocations. (doi: 10.1371/journal.pone.0167653) PLoS ONE 11(12): e0167653, 2016

  • Makunin AI, Kichigin IG, Larkin DM, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Yang F, Proskuryakova AA, Vorobieva NV, Chernyaeva EN, O’Brien SJ, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Contrasting origin of B chromosomes in two cervids (Siberian roe deer and grey brocket deer) unravelled by chromosomespecific DNA sequencing. (doi: 10.1186/s12864-016-2933-6) BMC Genomics 17: 618, 2016

  • Kichigin IG, Giovannotti M, Makunin AI, Ng BL, Kabilov MR, Tupikin AE, Barucchi VC, Splendiani A, Ruggeri P, Rens W, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Evolutionary dynamics of Anolis sex chromosomes revealed by sequencing of flow sorting-derived microchromosome-specific DNA. (doi: 10.1007/s00438-016-1230-z) Mol Genet Genomics 291: 1955-1966, 2016

  • Trifonov VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Stanyon R, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of acipenseriform genomes. (doi: 10.1007/s00412-016-0609-2) Chromosoma 125: 661-668, 2016

  • Tchurikov NA, Yudkin DV, Gorbacheva MA, Kulemzina AI, Grischenko IV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Kravatsky YuV, Kretova OV. Hot spots of DNA double-strand breaks in human rDNA units are produced in vivo. (doi: 10.1038/srep25866) Sci Reports 6: 25866, 2016

  • Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Comparative chromosome map and heterochromatin features of the gray whale karyotype (Cetacea). (doi: 10.1159/000445459) Cytogenet Genome Res 148: 25-34, 2016

  • Beklemisheva VR, Perelman PL, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Proskuryakova AA, Burkanov VN, Graphodatsky AS. The ancestral carnivore karyotype as substantiated by comparative chromosome painting of three pinnipeds, the walrus, the steller sea lion and the Baikal seal (Pinnipedia, Carnivora). (doi: 10.1371/journal.pone.0147647) PLoS ONE 11(1): e0147647, 2016

  • Romanenko SA, Lemskaya NA, Trifonov VA, Serdyukova NA, O’Brien PCM, Bulatova NSh, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Genome-wide comparative chromosome maps of Arvicola amphibius, Dicrostonyx torquatus, and Myodes rutilus. (doi: 10.1007/s10577-015-9504-6) Chromosome Res 24: 145-159, 2016

  • Куслий МА, Дружкова АС, Попова КО, Воробьева НВ, Макунин АИ, Юрлова АА, Тишкин АА, Миняев СС, Трифонов ВА, Графодатский АС, Дымова МА, Филипенко МЛ. Генотипирование и определение масти древних лошадей Бурятии. Цитология 58: 304-308, 2016

  • Romanenko SA. Review on cytogenetic studies in mammals. Chromosome Res 24 (Suppl 1): S26-S27, 2016

  • Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Lemskaya NA, Perelman PL, Graphodatsky AS. Chromosome organization features of the grey whale (Cetacea). Chromosome Res 24 (Suppl 1): S28, 2016 

  • Trifonov  VA, Romanenko SS, Beklemisheva VR, Biltueva LS, Makunin AI, Lemskaya NA, Kulemzina AI, Prokopov DY, Vorobieva NV, Graphodatsky AS. Evolutionary plasticity of Sturgeon genomes. Cytogenet Genome Res 148: 103, 2016

  • Beklemisheva  V, Perelman P, Lemskaya N, Kulemzina A, Proskuryakova A, Burkanov V, Graphodatsky A. Refinement of the ancestral Carnivore karyotype based on comparative chromosome painting of Pinnipeds (Pinnipedia, Carnivora). Cytogenet Genome Res 148: 105, 2016

  • Жимулев ИФ, Графодатский АС. Хромосома 2015. Цитология 58: 247, 2016

2015

  • Dobrynin P,... Makunin A,... Perelman P,... O’Brien SJ. Genomic legacy of the African cheetah, Acinonyx jubatus. (doi: 10.1186/s13059-015-0837-4) Genome Biology 16: 277, 2015

  • Matveevsky S, Bakloushinskaya I, Tambovtseva V, Romanenko S, Kolomiets O. Analysis of meiotic chromosome structure and behavior in Robertsonian heterozygotes of Ellobius tancrei (Rodentia, Cricetidae): a case of monobrachial homology. (doi: 10.3897/CompCytogen.v9i4.5674) Comp Cytogenet 9: 691-706, 2015

  • Romanenko SA, Biltueva LS, Serdyukova NA, Kulemzina AI, Beklemisheva VR, Gladkikh OL, Lemskaya NA, Interesova EA, Korentovich MA, Vorobieva NV, Graphodatsky AS, Trifonov VA. Segmental paleotetraploidy revealed in sterlet (Acipenser ruthenus) genome by chromosome painting. (doi: 10.1186/s13039-015-0194-8) Mol Cytogenet 8: 90, 2015

  • Korolyuk E, Makunin A, Matveeva T. Relationships and generic delimitation of Eurasian genera of the subtribe Asterinae (Astereae, Asteraceae) using molecular phylogeny of ITS. (doi: 10.3906/bot-1410-12) Turkish J Botany 39: 808-824, 2015

  • Lemskaya NA, Kartavtseva IV, Rubtsova NV, Golenishchev FN, Sheremetyeva IN, Graphodatsky AS. Chromosome polymorphism in Microtus (Alexandromys) mujanensis (Arvicolinae, Rodentia). (doi: 10.1159/000439096) Cytogenet Genome Res 146: 238-242, 2015 

  • Дружкова АС, Воробьева НВ, Трифонов ВА, Графодатский АС. Древняя ДНК: итоги и перспективы (к 30-летию начала исследований). Генетика 51: 627–643, 2015

  • Romanenko SA, Perelman PP, Trifonov VA, Serdyukova NA, Li T, Fu B, O’Brien PCM, Ng BL, Nie W, Liehr T, Stanyon R, Graphodatsky AS, Yang F. A first generation comparative chromosome map between guinea pig (Cavia porcellus) and humans. (doi: 10.1371/journal.pone.0127937) PLoS ONE 10(5): e0127937, 2015

  • Johnson JL, Kosyza A, Kharlamova AV, Gulevich RG, Perelman PL, Fong HTW, Vladimirova AV, Oskina IN, Trut LN, Kukekova AV. Platinum coat color in red fox (Vulpes vulpes) is caused by a mutation in an autosomal copy of KIT. (doi: 10.1111/age.12270) Anim Genet 46: 190-199, 2015

  • Юдкин ДВ, Лемская НА, Грищенко ИВ, Дольский АА. Изменение состава хроматина при экспансии тринуклеотидного повтора CGG в гене fmr1. Молекулярная биология 49: 205-211, 2015

2014

  • Biltueva L, Kulemzina A, Vorobieva N, Perelman P, Kochneva M, Zhidenova A, Graphodatsky A. A new case of an inherited reciprocal translocation in cattle: rcp(13;26)(q24;q11). (doi: 10.1159/000368950) Cytogenet Genome Res 144: 208-211, 2014

  • Avila F, Baily MP, Perelman P, Das PJ, Pontius J, Chowdhary R, Owens E, Johnson WE, Merriwether DA, Raudsepp T. A comprehensive whole-genome integrated cytogenetic map for the alpaca (Lama pacos). (doi: 10.1159/000370329) Cytogenet Genome Res 144: 193-204, 2014

  • Jarvis ED,... Perelman P,... Zhang G. Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds. (doi: 10.1126/science.1253451) Science 346: 1320-1331, 2014

  • Makunin AI, Dementyeva PV, Graphodatsky AS, Volobujev VT, Kukekova AV, Trifonov VA. Genes on B chromosomes of vertebrates. (doi: 10.1186/s13039-014-0099-y) Mol Cytogenet 7: 99, 2014

  • Avila F, Das PJ, Kutzler M, Owens E, Perelman P, Rubes J, Hornak M, Johnson WE, Raudsepp T. Development and application of camelid molecular cytogenetic tools. (doi: 10.1093/jhered/ess067) J Hered 105: 858-869, 2014

  • Kulemzina AI, Perelman PL, Grafodatskaya DA, Nguyen TT, Thompson M, Roelke-Parker ME, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting of pronghorn (Antilocapra americana) and saola (Pseudoryx nghetinhensis) karyotypes with human and dromedary camel probes. (doi: 10.1186/1471-2156-15-68) BMC Genetics 15: 68, 2014

2013

  • Thalmann O,... , Druzhkova A, Graphodatsky A,... Wayne RK. Complete mitochondrial genomes of ancient canines suggest a European origin of domestic dogs. (doi: 10.1126/science.1243650) Science 342: 871-874, 2013

  • Kosyakova N, Hamid AB, Chaveerach A, Pinthong K, Siripiyasing P, Supiwong W, Romanenko S, Trifonov V, Fan X. Generation of multicolor banding probes for chromosomes of different species. (doi: 10.1186/1755-8166-6-6) Mol Cytogen 6: 6, 2013

  • Bakloushinskaya I, Romanenko SA, Serdukova NA, Graphodatsky AS, Lyapunova EA. A new form of the mole vole Ellobius tancrei Blasius, 1884 (Mammalia, Rodentia) with the lowest chromosome number. (doi: 10.3897/CompCytogen.v7i2.5350) Comp Cytogenet 7: 163-169, 2013

  • Cernohorska H, Kubickova S, Kopecna O, Kulemzina AI, Perelman PL, Elder FFB, Graphodatsky A, Rubes J. Molecular cytogenetic insights to the phylogenetic affinities of the giraffe (Giraffa camelopardalis) and pronghorn (Antilocapra americana). (doi: 10.1007/s10577-013-9361-0) Chromosome Res 21: 447-460, 2013

  • Trifonov VA, Dementyeva PV, Larkin DM, O’Brien PCM, Perelman PL, Yang F, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Transcription of a protein-coding gene on b-chromosomes of the siberian roe deer (Capreolus pygargus). (doi: 10.1186/1741-7007-11-90) BMC Biology 11: 90, 2013

  • Romanenko SA, Lebedev VS, Serdukova NA, Feoktistova NY, Surov AV, Graphodatsky AS. Comparative cytogenetics of hamsters of the genus Allocricetulus, Argyropulo 1932 (Cricetidae, Rodentia). (doi: 10.1159/000346194) Cytogen Genome Res 139: 258-266, 2013

  • Tchurikov NA, Kretova OV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Grachev SA, Serebraykova MV, Romanenko SA, Vorobieva NV, Kravatsky YV. DNA double-strand breaks coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 binding sites flank coordinately expressed domains in human chromosomes. (doi: 10.1371/journal.pgen.1003429) PLoS Genet 9(4): e1003429, 2013

  • Druzhkova AS, Thalmann O, Trifonov VA, Leonard JA, Vorobieva NV, Ovodov ND, Graphodatsky AS, Wayne RK. Ancient DNA analysis affirms the canid from Altai as a primitive dog. (doi: 10.1371/journal.pone.0057754) PLoS ONE 8(3): e57754, 2013

  • Картавцева ИВ, Шереметьева ИН, Романенко СА, Гладких ОЛ, Рябкова АВ. Изменчивость хромосом полевки Максимовича Microtus maximowiczii (Rodentia, Cricetidae, Microtus). Цитология 55: 261-263, 2013

  • Кулемзина АИ. Эволюция кариотипов подотряда жвачных (Ruminantia). Цитология 55: 264-267, 2013

  • Макунин АИ, Трифонов ВА. Современные методы анализа добавочных хромосом. Цитология 55: 148–152, 2013

  • Косякова Н, Трифонов В, Романенко С, Мкртчан Х, Графодатский А, Лир Т. Многоцветный бэндинг хромосом мыши. Цитология 55: 259-260, 2013

  • Булатова НШ, Павлова СВ, Романенко СА, Сердюкова НА, Голенищев ФН, Малыгин ВМ, Лавренченко ЛА. Молекулярно-цитогенетические маркеры криптических видов и гибридов надвидового комплекса обыкновенных полевок Microtus arvalis s.l. Цитология 55: 268-270, 2013

2012

  • Dumas F, Houck M, Bigoni F, Perelman P, Romanenko SA, Stanyon R. Chromosome painting of the pygmy tree shrew shows that no derived cytogenetic traits link Primates and Scandentia. Cytogen Genome Res 136: 175-179, 2012

  • Bakloushinskaya IY, Matveevsky SN, Romanenko SA, Serdukova NA, Kolomiets OL, Spangenberg VE, Lyapunova EA, Graphodatsky AS. A comparative analysis of the mole vole sibling species Ellobius tancrei and E. talpinus (Cricetidae, Rodentia) through chromosome painting and examination of synaptonemal complex structures in hybrids. Cytogen Genome Res 136: 199-207, 2012

  • Graphodatsky A, Ferguson-Smith MA, Stanyon R. A short introduction to cytogenetics studies in mammals with reference to the present volume. Cytogen Genome Res 137: 83-96, 2012

  • Perelman PL, Beklemisheva VR, Yudkin DV, Petrina TN, Rozhnov VV, Nie W, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting in Carnivora and Pholidota. Cytogen Genome Res 137: 174-193, 2012

  • Rubes J, Musilova P, Kopecna O, Kubickova S, Cernohorska H, Kulemsina AI. Comparative molecular cytogenetics in Cetartiodactyla. Cytogen Genome Res 137: 194-207, 2012

  • Trifonov VA, Musilova P, Kulemsina AI. Chromosome evolution in the Perissodactyla. Cytogen Genome Res 137: 208-217, 2012

  • Romanenko SA, Volobouev V. Non-sciuromorph rodents karyotypes in evolution. Cytogen Genome Res 137: 233-245, 2012

  • Romanenko SA, Perelman PL, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Rodentia. Heredity 108: 4-16, 2012

  • Nie W, Wang J, Su W, Wang D, Tanomtong A, Perelman PL, Graphodatsky AS, Yang F. Chromosomal rearrangements and karyotype evolution in carnivores revealed by chromosome painting. Heredity 108: 17-27, 2012

  • Wong PBY, Wiley EO, Johnson WE, Ryder OA, O’Brien SJ, Haussler D, Koepfli K-P, Houck ML, Perelman P, Mastromonaco G, Bentley AC, Venkatesh B, Zhang Y, Murphy RW. Genome 10K community of scientists: Tissue sampling and standards for vertebrate genomics. GigaScience 1:8, 2012

  • Stanyon R, Graphodatsky A. (Ed’s) Evolutionary dynamics of mammalian karyotypes. Karger, Basel, Switzerland, 2012, 208 pp

2011

  • Perelman P, Johnson WE, Roos C, Seuanez HN, Horvath JE, Moreira MAM, Kessing B, Pontius J, Roelke M, Rumpler Y, Schneider MPC, Silva A, O'Brien SJ, Pecon-Slattery J. A molecular phylogeny of living primates. PLoS Genet 7(3): e1001342, 2011

  • Vorobieva NV, Sherbakov DY, Druzhkova AS, Stanyon R, Tsybankov AA, Vasiljev SK, Shunkov MV, Trifonov VA, Graphodatsky AS. Genotyping of Capreolus pygargus fossil DNA from Denisova Cave reveals phylogenetic relationships between ancient and modern populations. PLoS One 6(8): e24045, 2011

  • Beklemisheva VR, Romanenko SA, Biltueva LS, Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdukova NA, Rubtsova NV, Brandler OV, O'Brien PCM, Yang F, Stanyon R, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Reconstruction of karyotype evolution in core Glires. I. The genome homology revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 19: 549-565, 2011

  • Kulemzina AI, Yang F, Trifonov VA, Ryder OA, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Chromosome painting in Tragulidae facilitates the reconstruction of Ruminantia ancestral karyotype. Chromosome Res 19: 531-539, 2011

  • Duke Becker SE, Thomas R, Trifonov VA, Wayne RK, Graphodatsky AS, Breen M. Anchoring the dog to its relatives reveals new evolutionary breakpoints across 11 species of the Canidae and provides new clues for the role of B chromosomes. Chromosome Res 19: 685-708, 2011

  • Kulemzina AI, Nie W, Trifonov VA, Staroselec Y, Vasenkov DA, Volleth M, Yang F, Graphodatsky AS. Comparative chromosome painting of four Siberian vespertilionidae species with aselliscus stoliczkanus and human probes. Cytogenet Genome Res 134: 200-205, 2011

  • Biltueva L, Vorobieva N, Perelman P, Trifonov V, Volobouev V, Panov V, Ilyashenko V, Onischenko S, O'Brien P, Yang F, Ferguson-Smith M, Graphodatsky A. Karyotype evolution of Eulipotyphla (Insectivora): The genome homology of seven sorex species revealed by comparative chromosome painting and banding data. Cytogenet Genome Res 135: 51-64, 2011

  • Ye J, Nie W, Wang J, Su W, Jing M, Graphodatsky AS, Yang F. Genome-wide comparative chromosome map between human and the Forrest's pika (Ochotona forresti) established by cross-species chromosome painting: Further support for the glires hypothesis. Cytogenet Genome Res 132: 41-46, 2011

  • Graphodatsky AS, Trifonov VA, Stanyon R. The genome diversity and karyotype evolution of mammals. Molecular Cytogenetics 4:22, 2011

2010

  • Dementyeva PV, Trifonov VA, Kulemzina AI, Graphodatsky AS. Reconstruction of the putative Cervidae ancestral karyotype by chromosome painting of Siberian roe deer (Capreolus pygargus) with dromedary probes. Cytogenet Genome Res 128: 228-235, 2010

  • Lemskaya NA, Romanenko SA, Golenishchev FN, Rubtsova NV, Sablina OV, Serdukova NA, O’Brien PCM, Fu B, Yiğit N, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). III. Karyotype relationships of ten Microtus species. Chromosome Res 18: 473-486, 2010 

  • Trifonov VA, Kosyakova N, Romanenko SA, Stanyon R, Graphodatsky AS, Liehr T. New insights into the karyotypic evolution in muroid rodents revealed by multicolor banding applying murine probes. Chromosome Res 18: 265-275, 2010

  • Баклушинская ИЮ, Романенко СА, Графодатский АС, Матвеевский СН, Ляпунова ЕА, Коломиец ОЛ. Роль хромосомных перестроек в эволюции слепушонок рода Ellobius (Rodentia, Mammalia). Генетика 46: 1290-1293, 2010

  • Романенко СА, Лемская НА, Беклемишева ВР, Перельман ПЛ, Сердюкова НА, Графодатский АС. Сравнительная цитогенетика грызунов. Генетика 46: 1285-1289, 2010

  • Трифонов ВА, Дементьева ПВ, Беклемишева ВР, Юдкин ДВ, Воробьева НВ, Графодатский АС. Добавочные хромосомы, сегментные дупликации и эволюция. Генетика 46: 1234-1236, 2010

  • Кулемзина АИ, Билтуева ЛС, Трифонов ВА, Перельман ПЛ, Староселец ЯЮ, Беклемишева ВР, Воробьева НВ, Сердюкова НА, Графодатский АС. Сравнительная цитогенетика основных таксонов Laurasiatheria. Генетика 46: 1278-1284, 2010

  • Пристяжнюк ИЕ, Матвеева НМ, Графодатский АС, Сердюкова ИА, Серов ОЛ. Хромосомный состав межвидовых эмбриональных стволовых гибридных клеток мыши. Цитология 52: 136-143, 2010

2009

  • Kulemzina AI, Trifonov VA, Perelman PL, Rubtsova V, Volobuev V, Ferguson-Smith MA, Stanyon R, Yang F, Graphodatsky AS. Cross-species chromosome painting in Cetartiodactyla: reconstructing the karyotype evolution in key phylogenetic lineages. Chromosome Res 17: 419-436, 2009

  • Kukekova AV, Vorobieva NV, Beklemisheva VR, Johnson JL, Temnykh V, Yudkin DV, Trut LN, Andre C, Galibert F, Aguirre GD, Acland GM, Graphodatsky AS. Chromosomal mapping of canine-derived BAC clones to the red fox and American mink genomes. J Heredity 100: S42-S53, 2009

  • Genome 10K Community of Scientists. A proposal to obtain whole genome sequence for 10 000 vertebrate species.
    J Heredity 100: 659-674, 2009

2008

  • Trifonov VA, Stanyon R, Nesterenko AI, Fu B, Perelman PL, O’Brien PCM, Stone G, Rubtsova NV, Houck ML, Robinson TJ, Ferguson-Smith MA, Dobigny G, Graphodatsky AS, Yang F. Multi-directional cross-species painting illuminates the history of karyotypic evolution in Perissodactyla. Chromosome Res 16: 89-107, 2008

  • Graphodatsky AS, Perelman PL, Sokolovskaya NV, Beklemisheva VR, Serdukova NA, O’Brien PCM, Ferguson-Smith MA, Yang F. Phylogenomics of the dog and fox family (Canidae, Carnivora) revealed by chromosome painting. Chromosome Res 16: 129-143, 2008

  • Graphodatsky AS, Yang F, Dobigny G, Romanenko SA, Biltueva LS, Perelman PL, Beklemisheva VR, Alkalaeva EZ, Serdukova NA, Ferguson-Smith MA, Murphy WJ, Robinson TJ. Tracking genome organization in rodents by ZOO-FISH. Chromosome Res 16: 261-274, 2008

  • Huang L, Nesterenko A, Nie W, Wang J, Su W, Graphodatsky AS, Yang F. Karyotypic evolution of giraffes (Giraffa camelopardalis) revealed by cross-species chromosome painting with Chinese muntjac (Muntiacus reevesi) and human (Homo sapiens) paints. Cytogenet Genome Res 122: 132-138, 2008

  • Trifonov V, Fluri S, Binkert F, Nandini A, Andersen J, Rodriguez L, Gross M, Kosyakova N, Mkrtchyan H, Ewers E, Reich D, Weise A, Liehr T. Complex rearranged small supernumerary marker chromosomes (sSMC), three new cases; evidence for an underestimated entity? Mol Cytogenet 1: 6, 2008

  • Perelman PL, Graphodatsky AS, Dragoo JW, Serdyukova NA, Stone G, Cavagna P, Menotti A, Nie W, O’Brien PCM, Wang J, Burkett S, Yuki K, Yang F, Stanyon R. Chromosome painting shows skunks (Mephitidae, Carnivora) have highly rearranged karyotypes. Chromosome Res 16: 1215-1231, 2008

2007

  • Romanenko SA, Volobouev VT, Perelman PL, Lebedev VS, Serdukova NA, Trifonov VA, Biltueva LS, Nie W, O’Brien PCM, Bulatova NS, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of hamsters (Cricetidae, Muroidea, Rodentia) inferred from chromosomal painting and banding comparison. Chromosome Res 15: 283-297, 2007

  • Balmus G, Trifonov VA, Biltueva LS, O’Brien PCM, Alkalaeva ES, Fu B, Skidmore JA, Allen WR, Graphodatsky AS, Yang F, Ferguson-Smith MA. Cross-species chromosome painting among camel, cattle, pig and human: further insights into the putative Cetartiodactyla karyotype. Chromosome Res 15: 499-514, 2007

  • Sitnikova NA, Romanenko SA, O’Brien PCM, Perelman PL, Fu B, Rubtsova NV, Serdukova NA, Golenishchev FN, Trifonov VA, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). I. The genome homology of tundra vole, field vole, mouse and golden hamster revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 15: 447-456, 2007

  • Romanenko SA, Sitnikova NA, Serdukova NA, Perelman PL, Rubtsova NV, Bakloushinskaya IY, Lyapunova EA, Just W, Ferguson-Smith MA, Yang F, Graphodatsky AS. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). II. The genome homology of two mole voles (genus Ellobius), the field vole and golden hamster revealed by comparative chromosome painting. Chromosome Res 15: 891-897, 2007

  • Yudkin DV, Trifonov VA, Kukekova AV, Vorobieva NV, Rubtsova NV, Yang F, Acland GM, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Assignment of some sequences to Canidae autosomes and B-chromosomes by FISH and PCR-screening. Cytogenet Genome Res 116: 100-103, 2007

  • Kukekova AV, Trut LN, Oskina IN, Johnson JL, Temnykh SV, Kharlamova AV, Shepeleva D, Gulievich RG, Shikhevich SG, Graphodatsky AS, Aguirre GD, Acland GM. A Meiotic Linkage Map of the Silver Fox. Genome Res 17: 387-399, 2007

  • Just W, Baumstark A, Süß A, Graphodatsky A, Rens W, Schäfer N, Bakloushinskaya I, Hameister H, Vogel W. Ellobius lutescens: sex determination and sex chromosome. Sex Dev 1: 211-221, 2007

  • Графодатский АС. Сравнительная хромосомика. Молекулярная Биология 41: 408-422, 2007

  • Пузаков МВ, Баттулин НР, Темирова СА, Матвеева НМ, Сердюкова НА, Графодатский АС, Серов ОЛ. Анализ экспрессии родительских аллелей Xist и Gla в межвидовых эмбриональных гибридных клетках в условиях индуцированной in vitro инактивации X-хромосом. Онтогенез 38: 205-212, 2007

Отдел регуляции генетических процессов

Служебные ссылки