Молодежная лаборатория ИМКБ СО РАН: путь к новым методам терапии воспалительных заболеваний кишечника

Сайт Наука в Сибири 10 сентября 2024 г.

В Институте молекулярной и клеточной биологии СО РАН начинает работу молодежная лаборатория моделирования патологий человека. Ученые — победители гранта национального проекта “Наука и университеты” — активно исследуют молекулярно-генетические механизмы развития воспалительных заболеваний кишечника и разрабатывают новые подходы для их лечения. 

Молодежную лабораторию основали в мае 2024 года. Ученые уже приступили к реализации плана, который поддержало Минобрнауки России. “Тематика нашей лаборатории логично вытекает из предыдущего проекта, финансируемого грантом Российского научного фонда. Мы пытались предсказать общие механизмы, характерные для воспалительных заболеваний кишечника лабораторных животных. Нам стало интересно, будут ли эти механизмы воспроизводиться на человеке”, — поясняет заведующая лабораторией моделирования патологий человека и молодежной лабораторией кандидат биологических наук Елена Николаевна Кожевникова.

nvs_09_2024.jpg

Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК) — это группа хронических заболеваний, которые поражают желудочно-кишечный тракт и вызывают воспаление его слизистой оболочки. К ним относятся болезнь Крона и язвенный колит. С каждым годом такие состояния всё чаще выявляют у людей в возрасте от 20 до 40 лет. На сегодняшний день не существует действенных препаратов для полного избавления от ВЗК. Для большинства пациентов это неизлечимые заболевания, с которыми им приходится мириться всю жизнь.

Воспалительные заболевания кишечника до недавнего времени никто не пытался лечить генотерапевтическими методами, потому что сложно найти какую-то одну мутацию, которая их вызывает. Существует несколько подходов в разработке направленной терапии, но идея всегда одинаковая. Известна некая мишень — как правило, это ген или область генома, не обязательно кодирующая часть, в которой необходимо что-то исправить. Задача ученых — разработать препарат и понять, каким образом лучше доставить его к мишени. За последние 15 лет зарегистрированных генотерапевтических препаратов становилось всё больше. Сегодня зарубежные компании выводят на рынок качественные, но дорогостоящие лекарства, которые чаще всего направлены на лечение орфанных (редких) болезней. 

“Мы используем различные подходы для исследования воспалительных заболеваний кишечника. ВЗК не обусловлены одной конкретной причиной или мутацией. Наша цель — найти что-то общее в формировании этого недуга. Если выяснится, что при ВЗК меняется активность одного гена или группы, мы попробуем доставлять генотерапевтические препараты для включения или выключения этих генов в эпителиальной ткани кишечника. У нас есть разные подходы: мы можем использовать интерферирующие РНК для выключения генов или изменения их сплайсинга (процесс удаления из молекулы РНК определенных участков и соединения оставшихся в одну молекулу. — Прим. ред.) либо доставлять специальные белки в комплексе с нуклеиновыми кислотами для инактивации генов. Для нас важно опираться на прошлый опыт в этой области, чтобы использовать имеющиеся наработки”, — говорит Елена Кожевникова.

Есть случаи, при которых генотерапия становится единственным эффективным способом лечения, позволяющим пациентам с редкими заболеваниями получить шанс на улучшение качества жизни и здоровья. Если поврежденный ген отвечает за производство определенного продукта, например при диабете или гормональных нарушениях, можно использовать заместительную терапию: вводить инсулин или давать гормоны. Однако существуют заболевания, при которых только генотерапия поможет справиться с последствиями врожденных мутаций. Пример — мышечная дистрофия, когда гены отвечают за регуляцию процесса формирования нервно-мышечных контактов.

Лучше понять сложные процессы, которые происходят в организме человека, ученым помогают модельные животные. Сотрудники молодежной лаборатории проводят исследования на специально выведенных мышах со сломанным геном.

“Мы работаем с нокаутной линией мышей Muc2, которую создали в Медицинском колледже Альберта Эйнштейна (США) и привезли в виварий Института цитологии и генетики СО РАН. Это очень хорошая модель хронических вялотекущих воспалительных заболеваний кишечника. Когда нарушается муциновый барьер — защитный слой, который выстилает кишку изнутри, могут возникать воспаления. У мышей Muc2 сломан ген муцин-2, из-за чего у них развивается колит”, — рассказывает научный сотрудник лаборатории моделирования патологии человека кандидат биологических наук Юлия Владимировна Попова.

В молодежную лабораторию берут самых мотивированных студентов и предлагают достойные условия для работы и развития, каждый сможет проявить себя и реализовать свои идеи.

“Сейчас наша лаборатория активно ищет аспирантов. С молодыми учеными прекрасно сотрудничать: они создают позитивную атмосферу в лаборатории, много времени проводят вместе и постоянно что-то придумывают. Ребята больше работают руками, а мы отвечаем за организационную часть или пишем статьи. Наша задача, как старших коллег, не только делиться знаниями, но еще делать профессию более привлекательной для молодых людей. Я не представляю, какой была бы наша страна через 50 лет без науки”, — отмечает Елена Кожевникова.

На данный момент в лаборатории трудятся четверо студентов и аспирантов, которые параллельно продолжают обучение в университете. У каждого из них собственные планы и амбиции, но все они увлечены наукой и идеями молодежной лаборатории. 

“Раньше я была электронным микроскопистом и занималась только этим методом. Но мне всегда хотелось работать над полноценным проектом и осваивать что-то новое. Я попала в лабораторию Елены Николаевны Кожевниковой еще в Научно-исследовательском институте нейронаук и медицины. Затем мы переехали в Институт молекулярной и клеточной биологии и основали собственную лабораторию моделирования патологий человека. За три года работы я освоила конфокальную лазерную микроскопию, научилась работать с клеточными культурами и создавать трехмерные культуры органов — органоиды. Мы извлекаем из взрослой мыши стволовые клетки, которые находятся в толстой кишке, и выращиваем их в специальном матриксе. Они начинают замыкаться сами на себя и формировать сферообразные структуры, имитирующие кишку в микроскопическом масштабе по своей архитектонике”, — объясняет младший научный сотрудник студентка третьего курса аспирантуры Снежанна Сергеевна Медведева.

В области биомедицины каждый новый шаг приближает ученых к открытиям, которые смогут существенно изменить качество жизни пациентов. У сотрудников лаборатории моделирования патологий человека глобальные планы на этот счет.

“Уже много лет мы специализируемся на лабораторных животных, моделируем на них воспалительные заболевания кишечника. Хотелось бы работать с образцами от пациентов с ВЗК. Поэтому сейчас мы взаимодействуем с заведующим научно-исследовательской группой эпигенетики и метагеномики Института перинатологии и педиатрии ФГБУ “Национальный медицинский исследовательский центр им. В. А. Алмазова” Минздрава России и вице-президентом Российского общества по изучению воспалительных заболеваний кишечника кандидатом медицинских наук Станиславом Игоревичем Ситкиным. Планируем поработать вместе с врачами, чтобы обсудить с ними подходы и проверить нашу гипотезу на пациентах с подтвержденным диагнозом. Наработки по 3D-клеточным системам могут быть использованы не только в заявленном проекте, но и совместно с результатами других групп способствовать созданию отечественных лекарств”, — делится планами Елена Кожевникова.

Софья Казакова
студентка отделения журналистики Гуманитарного института НГУ