Отдел структуры и функции хромосом

Лаборатория молекулярной генетики

Вершинин Александр Васильевич
Заведующий лабораторией
тел: 363-90-74
тел: 363-90-75

Сотрудники: 
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg eLIBRARY_logo.png Вершинин Александр Васильевич зав. лаб. дбн avershinatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Евтушенко Елена Васильевна снс кбн evtatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif     eLIBRARY_logo.png Терлецкий Александр Витальевич нс кбн terletskyatmcb [dot] nsc [dot] ru
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Гацкая Сима Сергеевна мнс    
        Трунин Сергей Алексеевич ст. лаб.    
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Титов Сергей Евгеньевич снс совм. кбн  
thomson_logo.gif scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Веряскина Юлия Андреевна снс совм. кбн juliaveratmcb [dot] nsc [dot] ru
        Елисафенко Евгений Анатольевич нс совм. кбн  
  scopus_logo.jpg   eLIBRARY_logo.png Иванов Михаил Константинович нс совм. кбн  
        Ковынев Игорь Борисович нс совм. кбн  
      eLIBRARY_logo.png Малахина Екатерина Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм. кмн  
        Климова Олеся Александровна ст. лаб.-иссл. совм.    
        Федорова Софья Сергеевна ст. лаб.-иссл. совм.    
        Шебуняева Яна Юрьевна ст. лаб.-иссл. совм.    
        Новожилов Николай Александрович ст. лаб. совм.    
        Пахомова Вера Владимировна ст. лаб. совм.    

Бывшие сотрудники:

Гаськов Дмитрий Юрьевич
Гришко Екатерина Олеговна
Гунбин Константин Владимирович, кбн
Колесников Николай Николаевич, дбн
Липихина Юлия Алексеевна
Сердюкова Ольга Станиславовна

Направления исследований: 
  • Молекулярная организация гетерохроматиновых районов хромосом ржи и механизмы, участвующие в формировании этих районов в процессе эволюции
  • Анализ геномной и хромосомной организации онкомикроРНК. Диагностика онкологических заболеваний по уровню экспрессии микроРНК
  • Генетическое разнообразие бабезий – возбудителей зооантропонозного, маляриеподобного заболевания животных и человека. Разработка методов ранней диагностики заболевания

 

ОБ ИССЛЕДОВАНИЯХ:

Недоступный маркер
Подходы к ранней диагностике рака
Тест-система по выявлению рака на ранних стадиях
Тест-системы позволяют увидеть рак на микроуровне
Микро-РНК, вездесущие и всемогущие: рак будет под контролем
Зачем клетке так много ДНК?

Публикации: 

  1. Evtushenko EV, Gatzkaya SS, Stepochkin PI, Vershinin AV. The parental centromere sizes remain unaltered in allopolyploid wheat-rye hybrids. Cytogenet Genome Res, 2024, doi: 10.1159/000541705

  2. Koroleva AG, Evtushenko EV, Zaytseva EP, Porfiriev AG, Timoshkin OA, Kirilchik SV. Interstitial telomere sequences in chromosomes of Baikal planarians. (doi: 10.31951/2658-3518-2024-A-1-1) Limnology and Freshwater Biology 1: 1-13, 2024

  3. Ye WD, Tan LC, Veryaskina YA, Han PZ, Yu PC, Shi X, Liu WL, Kai ZT, Lin RJ, Huang LS, Semenov A, Zhimulev IF, Ji QH, Qu N, Titov SE, Wang YL. Synchronous papillary and follicular thyroid carcinomas: the first retrospective cohort study and literature review. (doi: 10.21037/tcr-23) Transl Cancer Res 13(4): 1924-1935, 2024

  4. Lukyanov SA, Sergiyko SV, Titov SE, Beltsevich DG, Veryaskina YA, Vanushko VE, Urusova LS, Mikheenkov AA, Kozorezova ES, Vorobyov SL, Sleptsov IV. New opportunities for preoperative diagnosis of medullary thyroid carcinoma. (doi: 10.3390/biomedicines11051473) Biomedicines 11(5): 1473, 2023

  5. Ivanov MK, Brenner EV, Hodkevich AA, Dzyubenko VV, Krasilnikov SE, Mansurova AS, Vakhturova IE, Agletdinov EF, Shumeikina AO, Chernyshova AL, Titov SE. Cervicovaginal-microbiome analysis by 16S sequencing and Real-Time PCR in patients from Novosibirsk (Russia) with cervical lesions and several years after cancer treatment. (doi: 10.3390/diagnostics13010140) Diagnostics 13(1): 140, 2023

  6. Титов СЕ, Лукьянов СА, Сергийко СВ, Веряскина ЮА, Ильина ТЕ, Козорезова ЕС, Воробьев СЛ. Проблемы диагностики фолликулярного рака щитовидной железы. (doi: 10.17650/2222-1468-2023-13-3-10-23) Опухоли головы и шеи 13(3): 10-23, 2023

  7. Veryaskina YA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Fyodorova SS, Shebunyaeva YY, Sumenkova DV, Zhimulev IF. MicroRNA expression profile in bone marrow and lymph nodes in B-cell lymphomas. (doi: 10.3390/ijms242015082) Int J Mol Sci 24(20): 15082, 2023

  8. Зыкова ТЮ, Мальцева МВ, Демаков СА, Похолкова ГВ, Веряскина ЮА, Лаврик ОИ, Колесникова ТД, Жимулев ИФ. Консервативный белок RCC1 – новый компонент черных дисков политенных хромосом Drosophila melanogaster. (doi: 10.31857/S0475145023020076) Онтогенез 54(2): 176-180, 2023

  9. Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Злокачественные новообразования щитовидной железы человека как следствие кровепаразитарной (гемоспоридийной) инфекции. (doi: 10.15789/2220-7619-MHT-1948) Инфекция и иммунитет 13(2): 257-274, 2023

  10. Vershinin AV, Elisafenko EA, Evtushenko EV. Genetic redundancy in rye shows in a variety of ways. (doi: 10.3390/plants12020282) Plants 12(2): 282, 2023

  11. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ковынев ИБ, Федорова СС, Шебуняева ЯЮ, Антоненко ОВ, Поспелова ТИ, Жимулев ИФ. Профилирование экспрессии микроРНК в В-крупноклеточной лимфоме. (doi: 10.31857/S0026898423030175) Молекулярная биология 57(3): 492-500, 2023

  12. Stupak EV, Veryasikina YA, Titov SE, Askandaryan AS, Hiana JC, Zhimulyov IF, Stupak VV. MicroRNAs in the diagnosis of malignancy of supratentorial brain gliomas and prognosis of disease progression. (doi: 10.7759/cureus.35906) Cureus 15(3): e35906, 2023

  13. Титов СЕ, Лукьянов СА, Козорезова ЕС, Деменков ПС, Сергийко СВ, Веряскина ЮА, Воробьев СЛ, Слепцов ИВ, Гостимский АВ. Валидация дооперационной диагностики злокачественных опухолей щитовидной железы с помощью молекулярного классификатора. (doi: 10.37469/0507-3758-2022-68-6-741-751) Вопросы онкологии 68(6): 741-751, 2022

  14. Mikhailova AG, ... Gunbin K, Popadin K. A mitochondria-specific mutational signature of aging: increased rate of A > G substitutions on the heavy strand (doi: 10.1093/nar/gkac779) Nucleic Acids Res 50(18): 10264-10277, 2022

  15. Титов СЕ. Молекулярный тест для дооперационной диагностики узловых образований щитовидной железы. Наука и технологии Сибири 4(7): 35-38, 2022

  16. Вершинин АВ, Евтушенко ЕВ, Гацкая СС, Люсиков ОМ, Гордей ИА. Молекулярно-цитогенетические методы, направленные на создание эффективной технологии получения гибридов тритикале и секалотритикум. Наука и технологии Сибири 4(7): 78-82, 2022

  17. Казачков ЕЛ, Семенов ЮА, Веряскина ЮА, Казачкова ЭА, Чижовская АВ. Профиль экспрессии ряда микроРНК в плаценте при своевременных и преждевременных родах. (doi: 10.31549/2542-1174-2022-6-1-22-37) Journal of Siberian Medical Sciences 6(1): 22-37, 2022

  18. Veryaskina YA, Titov SE, Zhimulev IF. Reference genes for qPCR-based miRNA expression profiling in 14 human tissues. (doi: 10.1159/000524283) Med Princ Pract 31: 322-332, 2022

  19. Рябинин ВА, Акимов ИА, Синяков АН, Пичко НП, Иванов МК. Диагностика рекомбинантной формы вируса гепатита С RF1_2k/1b с использованием микрочипа, функционирующего по принципу “много зондов/один спот”. (doi: 10.31857/S0132342322010092) Биоорганическая химия 48(1): 109-114, 2022

  20. Veryaskina YuA, Titov SE, Kovynev IB, Pospelova TI, Zhimulev IF. The profile of microRNA expression in bone marrow in non-Hodgkin’s lymphomas. (doi: 10.3390/diagnostics12030629) Diagnostics 12(3): 629, 2022

  21. Veryaskina YuA, Titov SE, Ivanov MK, Ruzankin PS, Tarasenko AS, Shevchenko SP, Kovynev IB, Stupak EV, Pospelova TI, Zhimulev IF. Selection of reference genes for quantitative analysis of microRNA expression in three different types of cancer. (doi: 10.1371/journal.pone.0254304) PLoS ONE 17(2): e0254304, 2022

  22. Elisafenko EA, Evtushenko EV, Vershinin AV. The origin and evolution of a two-component system of paralogous genes encoding the centromeric histone CENH3 in cereals. (doi: 10.1186/s12870-021-03264-3) BMC Plant Biol 21: 541, 2021

  23. Vershinin AV, Lux T, Gundlach H, Elisafenko EA, Keilwagen J, Mayer KFX, Spannagl M. The gene and repetitive element landscape of the rye genome. In: "The Rye Genome" (Rabanus-Wallace MT, Stein N, Eds), Springer, pp 117-133, 2021 (doi: 10.1007%2F978-3-030-83383-1_8)

  24. Evtushenko EV, Elisafenko EA, Gatzkaya SS, Schubert V, Houben A, Vershinin AV. Expression of two rye CENH3 variants and their loading into centromeres. (doi: 10.3390/plants10102043) Plants 10(10): 2043, 2021

  25. Сергийко СВ, Лукьянов СА, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Романчишен АФ, Гостимский АВ, Казачков ЕЛ, Пастернак ИА. Прогностические возможности молекулярно-генетического тестирования для оценки риска рецидива папиллярного рака щитовидной железы у детей. (doi: 10.37469/0507-3758-2021-67-4-511-517) Вопросы онкологии 67(4): 511-517, 2021

  26. Ivanov MK, Titov SE, Dzyubenko VV, Glushkov SA, Krasilnikov SE, Mansurova AS, Malek AV, Berlev IV, Prisyazhnaya TS, Kuleshova SV, Hodkevich AA, Lancuhaj YA, Dimitriadi TA, Agletdinov EF. Detection of cervical lesions and cancer in air-dried cytologic smears by combined analysis of mRNA and miRNA expression levels. (doi: 10.1016/j.jmoldx.2021.01.016) J Mol Diagn 23(5): 541-554, 2021

  27. Titov SE, Poloz TL, Veryaskina YA, Anishchenko VV. Cytological and molecular diagnosis of Hürthle cell thyroid tumors: Analysis of three cases. (doi: 10.3892/mco.2021.2311) Mol Clin Oncol 15(1): 149, 2021

  28. Konnikova MR, Cherkasova OP, Nazarov MM, Vrazhnov DA, Kistenev YV, Titov SE, Kopeikina EV, Shevchenko SP, Shkurinov AP. Malignant and benign thyroid nodule differentiation through the analysis of blood plasma with terahertz spectroscopy. (doi: 10.1364/BOE.412715) Biomed Opt Express 12(2): 1020-1035, 2021

  29. Лукьянов СА, Сергийко СВ, Титов СЕ, Веряскина ЮА, Мудунов АМ, Доброхотова ВЗ, Козорезова ЕС, Воробьев СЛ, Важенин АВ, Романчишен АФ, Вабалайте КВ, Вилкова АС, Тимофеева НИ, Ильина ТЕ. Новые возможности дооперационной диагностики анапластического рака щитовидной железы (doi: 10.17650/2222-1468-2021-11-1-34-40) Опухоли головы и шеи 11(1): 34-40, 2021

  30. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ковынев ИБ, Федорова СС, Поспелова ТИ, Жимулёв ИФ. микроРНК при миелодиспластическом синдроме. (doi: 10.32607/actanaturae.11209) Acta Naturae 13(2): 4-15, 2021

  31. Titov SE, Kozorezova ES, Demenkov PS, Veryaskina YA, Kuznetsova IV, Vorobyev SL, Chernikov RA, Sleptsov IV, Timofeeva NI, Ivanov MK. Preoperative typing of thyroid and parathyroid tumors with a combined molecular classifier. (doi: 10.3390/cancers13020237) Cancers 13(2): 237, 2021

Публикации за предыдущие годы

Финансирование: 

Программа фундаментальных научных исследований

FWGZ-2021-0014 (122011400181-7) Организация и функционирование геномов в интерфазных хромосомах. Жимулев ИФ

Гранты РНФ

24-25-20059 Роль генетических и эпигенетических механизмов в формировании злокачественной неходжкинской лимфомы кожи. Веряскина ЮА

Завершенные гранты

Материалы конференций: 

  1. Гацкая СС, Евтушенко ЕВ, Елисафенко ЕА, Вершинин АВ. Экспрессия генов CENH3 и пространственная организация родительских геномов в клетках аллополиплоидных гибридов злаков. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с.81. Новосибирск, 2023

  2. Евтушенко ЕВ, Гацкая CС, Новожилов НА, Вершинин АВ. Динамика включения вариантов центромерного гистона H3 в нуклеосомы центромер у аллополиплоидных гибридов ржи и пшеницы. Материалы международной конференции "Хромосома 2023". с.103-104. Новосибирск, 2023

  3. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Ковынев ИБ, Поспелова ТИ. Профиль экспрессии микроРНК в костном мозге у пациентов с острым миелоидным лейкозом и SARS-CoV-2. Успехи молекулярной онкологии 9(4, приложение): 60, 2022

  4. Elisafenko EA, Evtushenko EV, Vershinin AV. Tracing the origin and evolution of the locus containing paralogous CENH3 genes in cereals. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 144-145

  5. Evtushenko E, Elisafenko E, Gatskaya S, Vershinin A. CENH3 gene duplication leads to heterogeneous organization of centromeric chromatin in rye. The 13th International Multiconference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology", Abstract book (ISBN 978-5-91291-059-3), Novosibirsk, 2022, p. 602-603

  6. Федорова СС, Поспелова ТИ, Ковынев ИБ, Веряскина ЮА, Титов СЕ, Жимулев ИФ. Перспективы исследования микроРНК-профиля костного мозга при диффузной B-клеточной крупноклеточной лимфоме. Сборник тезисов XIX Российской конференции с международным участием "Злокачественные лимфомы". Москва, 2022. с. 29.

  7. Ковынев ИБ, Березина ОВ, Колесникова МА, Федорова СС, Поспелова ТИ, Веряскина ЮА, Титов СЕ, Жимулев ИФ. МикроРНК-профилирование костного мозго в ранней диагностике поражений гемопоэза у больных неходжкинской злокачественной лимфомой. Сборник тезисов XVIII Российской конференции с международным участием "Злокачественные лимфомы". Москва, 2021. с. 16-17.

  8. Ступак ЕВ, Титов СЕ, Ступак ВВ, Веряскина ЮА, Ахмерова ЛГ, Жимулев ИФ. миРНК как потенциальные предикторы выживания больных с супратенториальными глиобластомами головного мозга. Российский нейрохирургический журнал имени профессора АЛ Поленова 13(S1): 81-82, 2021 

  9. Koroleva AG, Maximova NV, Sapozhnikova YuP, Timoshkin OA, Zaytseva EP, Sitnikova TYa, Evtushenko EV, Vershinin AV, Sukhanova LV, Glyzina OYu, Kirilchik SV. Telomere biology of Baikal hydrobionts. (doi: 10.31951/2658-3518-2020-A-4-614) Limnology and Freshwater Biology 3(4, SI:7VBC): 614-615, 2020

  10. Титов СЕ, Иванов МК, Веряскина ЮА, Деменков ПС, Шевченко СП, Катанян ГА, Лукьянов СА. Выявление злокачественных опухолей щитовидной железы в мазках с неопределенным цитологическим заключением с помощью молекулярного классификатора. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020". Сборник тезисов. С-Пб: АННМО "Вопросы онкологии", 2020, ISBN 978-5-6043599-6-9, с. 112

  11. Веряскина ЮА, Титов СЕ, Воронцова ЕВ, Ковынев ИБ, Поспелова ТИ. Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020". Сборник тезисов. С-Пб: АННМО "Вопросы онкологии", 2020, ISBN 978-5-6043599-6-9, с. 270

  12. Абикеева ТА, Иванов МК, Дзюбенко ВВ. Выявление метилироваения генома вируса папилломы человека 16 типа для ранней диагностики тяжелых интраэпителиальных неоплазий и рака шейки матки. Сборник тезисов VII Международной конференции молодых ученых: биофизиков, биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов. Новосибирск, 2020. с. 367-369. ISBN 978-5-4437-1114-0

Материалы конференций за предыдущие годы

Доклады: 

  1. Gatskaya SS. Expression of CENH3 genes and spatial organization of parental genomes in cells of allopolyploid cereal hybrids. Международная конференция Хромосома 2023, 5-10 сентября 2023, Новосибирск

  2. Гацкая С. CENH3 gene duplication leads to heterogeneous organization of centromeric chromatin in rye. 13-я Международная мультиконференция "Биоинформатика геномной регуляции и Структурной/системной биологии" (BGRS/SB-2022) 4-8 июля 2022, Новосибирск

  3. Веряскина ЮА. Анализ профиля экспрессии микроРНК в клетках костного мозга при лимфоидных и миелоидных опухолях. VI Петербургский международный онкологический форум "Белые ночи 2020", 25-28 июня 2020, Санкт-Петербург

  4. Evtushenko EV. Evolutionary dynamics of the centomeric histone CENH3 in the Triticeae tribe. Международная конференция Хромосома-2018, 20-24 августа 2018, Новосибирск

  5. Вершинин АВ. Структура центромер и эволюция. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  6. Титов СЕ. МикроРНК - молекулярные маркеры онкологических заболеваний. Научная школа по молекулярной и клеточной биологии. 5-6 октября 2017, Новосибирск

  7. Колесников НН. MicroRNA- and somatic mutation-based ASSAY in the preoperative diagnostic of thyroid nodules. Eurasian Thyroid Cancer Forum, 1-3 октября 2016, Москва

  8. Vershinin A. The molecular mechanisms of the heterochromatin expansion in the rye chromosomes. 21st International Chromosome Conference. July 10-13, 2016, Foz do Iguaçu, Brazil

Доклады за предыдущие годы

Международное сотрудничество: 

  • Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung, Gatersleben, Germany
    Структура центромерных гистонов у различных видов злаков

  • Institute of Experimental Botany, Olomouc, Czech Republic
    Структура центромер у различных видов злаков

  • Институт генетики и цитологии, Минск, Беларусь
    Молекулярная организация центромер в хромосомах злаков

  • John Innes Centre, Norwich, UK
    Мобильные элементы гороха

Патенты: 

  • Титов СЕ, Лукьянов СА, Сергийко СВ, Веряскина ЮА. Способ дооперационной дифференциальной диагностики анапластического рака щитовидной железы. Патент на изобретение №2759128. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 09.11.2021

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ определения прогноза выживаемости больных с глиомами головного мозга Grade 2 - Grade 4. Патент на изобретение №2740481. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.01.2021

  • Ступак ЕВ, Рабинович СС, Ступак ВВ, Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Жимулев ИФ. Способ интраоперационного забора биоптата глиомы и морфологически неизменной ткани головного мозга для молекулярно-генетических исследований. Патент на изобретение №2651749. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 23.04.2018

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Ступак ВВ, Ступак ЕВ, Мишинов СВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики глиом головного мозга человека. Патент на изобретение №2583871. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 14.04.2016

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Цивликова ЕС, Полоз ТЛ, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Cпособ дифференциальной диагностики новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2569154. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 26.10.2015

  • Колесников НН, Титов СЕ, Ахмерова ЛГ, Веряскина ЮА, Иванов МК, Шевченко СП, Карпинская ЕВ, Жимулев ИФ. Способ определения доброкачественных и злокачественных новообразований щитовидной железы человека. Патент на изобретение №2548773. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 24.03.2015

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ диагностики кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2362995. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.07.2009

  • Терлецкий АВ, Ахмерова ЛГ. Способ приготовления вакцины против кровепаразитарных инфекций. Патент на изобретение №2373954. Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений Российской Федерации 27.11.2009

Награды: 

Премия Президиума СО АН СССР

Колесников НН (1984, 1990)

Памятный знак "За труд на благо города"

Вершинин АВ (2013)

Отдел регуляции генетических процессов

Служебные ссылки