Книги, монографии и отдельные главы в книгах

Stability_Genomes_2024.jpg

The Stability and Evolution of Genes and Genomes
eds. Viggiano L, Marsano RM
MDPI, Basel, Switzerland, 2024, 234 p, ISBN 978-3-0365-9802-4 (PDF)
printed edition of the Special Issue that was published in Genes
doi: 10.3390/books978-3-0365-9802-4

Romanenko SA, Malikov VG, Mahmoudi A, Golenishchev FN, Lemskaya NA, Pereira JC, Trifonov VA, Serdyukova NA, Ferguson-Smith MA, Aliabadian  Mansour, Graphodatsky AS. New data on comparative cytogenetics of the mouse-like hamsters (Calomyscus Thomas, 1905) from Iran and Turkmenistan. pp 56-72

Cyt_Mol_Cyt_2022_small.jpg

Cytogenetics and Molecular Cytogenetics
ed. Liehr T
CRC Press, Boca Raton, FL, USA, 2022, 382 p
doi: 10.1201/9781003223658

Chapter 3. Romanenko S, Trifonov V. Generation of microdissection-derived painting probes from single copy chromosomes. pp 27-34

Notch_2022_small.jpg

Notch Signaling Research
Methods Molecular Biology Series
ed. Jia D
Humana Press, New York, NY, USA, 2022, 298 p
doi: 10.1007/978-1-0716-2201-8

Chapter 1. Andreyenkov OV, Volkova EI, Andreyenkova NG, Demakov SA. Using the CRISPR/Cas9 system for dissection of functional sites of the Notch gene in Drosophila melanogaster. pp 1-14

Nuclear_pores_2022_small.jpg

The Nuclear Pore Complex
Methods Molecular Biology Series
ed. Goldberg MW
Humana Press, New York, NY, USA, 2022, 515 p
doi: 10.1007/978-1-0716-2337-4

Strunov A, Boldyreva LV, Pindyurin AV, Gatti M, Kiseleva E. TEM imaging of membrane choreography during mitosis of Drosophila tissue culture cells. pp 407-415

Rye_genome_2021.jpg

The Rye Genome
eds. Rabanus-Wallace MT, Stein N
Springer, 2021, 236 p
doi: 10.1007/978-3-030-83383-1

Vershinin AV, Lux T, Gundlach H, Elisafenko EA, Keilwagen J, Mayer KFX, Spannagl M. The gene and repetitive element landscape of the rye genome. pp 117-133

Ancient_genomes_2021.jpg

Ancient and Archaic Genomes
eds. Caramelli D, Lari M, Vai S
MDPI, Basel, Switzerland, 2021, 107 p, ISBN 978-3-0365-2546-4
printed edition of the Special Issue that was published in Genes

Kusliy MA, Vorobieva NV, Tishkin AA, Makunin AI, Druzhkova AS, Trifonov VA, Iderkhangai T-O, Graphodatsky AS. Traces of late Bronze and early Iron Age mongolian horse mitochondrial lineages in modern populations. pp 5-19

Mechanisms_2021.jpg

Mechanisms Driving Karyotype Evolution and Genomic Architecture
eds. Ruiz-Herrera A, Farré-Belmonte M
MDPI, Basel, Switzerland, 2021, 248 p
printed edition of the Special Issue that was published in Genes

Romanenko SA, Smorkatcheva AV, Kovalskaya YM, Prokopov DY, Lemskaya NA, Gladkikh OL, Polikarpov IA, Serdyukova NA, Trifonov VA, Molodtseva AS, O’Brien PCM, Golenishchev FN, Ferguson-Smith MA, Graphodatsky AS. Complex structure of Lasiopodomys mandarinus vinogradovi sex chromosomes, sex determination, and intraspecific autosomal polymorphism. pp 193-209

Proskuryakova AA, Kulemzina AI, Perelman PL, Yudkin DV, Lemskaya NA, Okhlopkov IM, Kirillin EV, Farré M, Larkin DM, Roelke-Parker ME, O’Brien SJ, Bush M, Graphodatsky AS. Comparative chromosome mapping of musk ox and the X chromosome among some bovidae species. pp 211-224

genetics_2021_small.jpg

Практическая молекулярная генетика для начинающих. 8-9 классы
(Ред. Бородин ПМ, Воронина ЕН)
Москва, Просвещение, 2021, 272 c

Модуль 2. Главы 4-7. Карташов М, Колесникова Т, Баттулин  Н. Устройство и работа генов. с. 28-57

Иллюстрации – Посух О

Diagnostika_2020_small.jpg

Воевода МИ, Рымар ОД, Шахтшнейдер ЕВ, Овсянникова АК, Иванощук ДЕ, Малахина ЕС, Сазонова ОВ
Диагностика и ведение пациентов с диабетом MODY: методические рекомендации для врачей
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2020, 48 c

microsuperheroes_2020_small.jpg

Посух О
Микросупергерои. Самые невидимые
Москва, Самокат, 2020, 80 с

Methods_2020.jpg

Методы редактирования генов и геномов 
(Отв. ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ВВ Власов) – Новосибирск: Издательство СО РАН, 2020, 550 с.

Глава 8. Андреенков ОВ, Волкова ЕИ, Демаков СА. Применение CRISPR/Cas9 для получения в геноме Drosophila melanogaster направленных делеций и введения сайта интеграции из системы attP/attB фага ФС31. с. 117-131

Глава 9. Романов СЕ, Лактионов ПП. Получение направленных делеций в геноме Drosophila melanogaster с помощью системы CRISPR/Cas9. с. 133-148

Genome_repair_2020.jpg

Mechanisms of Genome Protection and Repair. Advances in Experimental Medicine and Biology
(ed. D Zharkov), Series volume 1241. Springer, Germany, 2020

Chapter 7. Grishchenko IV, Purvinsh YV, Yudkin DV. Mystery of expansion: DNA metabolism and unstable repeats, pp 101-124

Atlas_2020_middle.jpg

Atlas of mammalian chromosomes
2nd edition
eds. Graphodatsky AS (Russia), Perelman PL (Russia), O’Brien SJ (USA)
Wiley-Blackwell, USA, 2020, 1008 p

PDF1.jpg Список людей, участвовавших в создании Атласа
microsuperheroes_2019_small.jpg

Посух О
Микросупергерои. Самые-самые самовосстанавливающиеся
Москва, Самокат, 2019, 80 с

Avid_Sci_2019.jpg

Top 10 Contributions on Genetics 
2nd ed. Avid Science, India, 2019

Chapter 10. Tchurikov NA, Kretova OV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Grachev SA, Serebraykova MV, Romanenko SA, Vorobieva NV, Kravatsky YuV. DNA double-strand breaks coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 binding sites flank coordinately expressed domains in human chromosomes

B_chr_2019.jpg

Evolution, composition and regulation of supernumerary B chromosomes
eds. Houben A (Germany), Jones N (UK), Martins C (Brasil), Trifonov V (Russia)
MDPI, Basel, Switzerland, 2019, 254 p

Printed edition of the Special issue
Evolution, composition and regulation of supernumerary B chromosomes
published in Genes 9, 2018

shrew_2019.jpg

Shrews, Chromosomes and Speciation
(eds. Searle J, Polly P, Zima J). Cambridge, Cambridge University Press, UK, 2019, 476 p

Chapter 5. Bulatova NS, Biltueva LS, Pavlova SV, Zhdanova NS, Zima J. Chromosomal differentiation in the common shrew and related species.  pp. 134-185

microsuperheroes_2018_small.jpg

Посух О
Микросупергерои. Самый живучий
Москва, Самокат, 2018, 64 с
 

editing_2018_v2_small.jpg

Редактирование генов и геномов
издание 2-е, в 3-х томах (ред. СМ Закиян, СП Медведев, ЕВ Дементьева, ЕА Покушалов, ВВ Власов) – Новосибирск: Издательство СО РАН, 2018

Том 2, Глава 19. Белякин СН, Максимов ДА
Направленное редактирование генома Drosophila melanogaster. с. 177-192

birds_2017_small.jpg

Жимулев ИФ
Орнитофауна Новосибирского Академгородка
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2017, 512 с

Functional Genomics. Methods and Protocols 
3rd edition (eds. M Kaufmann, C Klinger, F Savelsbergh), Series volume 1654. Humana Press, New York, USA, 2017, 392 p

Chapter 7. Pindyurin AV. Genome-wide cell type-specific mapping of in vivo chromatin protein binding using an FLP-inducible DamID system in Drosophila. pp. 99-124

 

Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide. 2nd edition
(ed. Liehr T) Springer-Verlag, Germany, 2017, 606 p

Yang F, Trifonov V, Ng BL, Kosyakova N, Carter NP. Generation of paint probes from flow-sorted and microdissected chromosomes. pp. 63-79

Trifonov VA, Vorobieva NV, Serdyukova NA, Rens W. FISH with and without COT1 DNA. pp. 123-132

Yang F, Graphodatsky AS. Animal probes and ZOO-FISH. pp. 395-415

Ладога и проблемы древной и средневековой истории северной Евразии. Сборник статей по материалам XIX и XX чтений памяти Анны и Дмитрия Алексеевича Мачинских.
Санкт-Петербург, Нестор-История, 2016, 184 с

Галкина СА, Демин АГ, Пантелеев АВ, Дружкова АС, Трифонов ВА, Григорьева НВ. Перспективы и методика анализа ДНК ископаемых костей домашней курицы, обнаруженных при археологических раскопках. c. 118-124

International Multidisciplinary Microscopy Congress:
Proceedings of InterM, Antalya, Turkey, October 10-13, 2013
(eds. Polychroniadis EK, Oral AY, Ozer M)
Springer-Verlag, Germany, 2014, 286 p

Chapter 33. Palchikova IG, Ivankina EA, Semeshin VF, Omelyanchuk LV, Zhimulev IF, Smirnov ES. DNA Feulgen cytophotometry and chromatin diminution. pp 233-239
Криохранение семян: итоги и перспективы
(отв. ред. Жимулев ИФ, Соломонов НГ, Соколов ВА)
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2014, 112 с
Subtelomeres
(eds. Louis EJ, Becker MM)
Springer-Verlag, Germany, 2014, 271 p

Chapter 11. Vershinin AV, Evtushenko EV. What is the specificity of plant subtelomeres?
pp 195-210
Птицы Новосибирского Академгородка: фотоальбом
(отв. ред. Андреенкова НГ, Жимулёв ИФ)
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2014, 328 с
Динамика экосистем Новосибирского Академгородка
(отв. ред. Жимулев ИФ)
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2013, 438 с
Evolutionary Dynamics of Mammalian Karyotypes
(Eds: Stanyon R (Italy), Graphodatsky A (Russia))
Reprint of: Cytogenet Genome Res 137(2-4), 2012 
Karger, Basel, Switzerland, 2012, 208 p
Эпигенетика
(ред. Закиян СМ, Власов ВВ, Дементьева ЕВ)
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2012, 592 с

Глава 1. Коряков ДЕ. Нуклеосомная организация хроматина. c 7-30
Глава 4. Колесникова ТД. Механизмы эпигенетического наследования. с. 89-106
Глава 5. Колесникова ТД. Пространственно-временная программа репликации ДНК. Эпигенетические механизмы регуляции в клеточном цикле и в развитии. с. 107-142
Глава 14. Горчаков АА, Демакова ОВ, Брусенцова ИВ. Дозовая компенсация у дрозофилы: механизм и эпигенетические аспекты. с. 359-384
Глава 17. Елисафенко ЕА, Колесников НН, Шевченко АИ, Закиян СМ. Эволюция процесса инактивации Х-хромосомы. с. 419-432
Глава 20. Иванкина ЕА. Диминуция хроматина с точки зрения эпигенетики. Механизм РНК-опосредованной перестройки генома в ходе элиминации у инфузорий. с. 465-479
Глава 23. Натальин ПБ, Белякин СН. Современные технологии секвенирования ДНК в эпигенетике. с. 535-561
Shamina NV
2nd Pollen Formation: 40 cytological mechanisms of nuclear meiotic restitution
Nova Scientific Publishers, USA, 2010, 120 pp
Fluorescence In Situ Hybridization (FISH). Application Guide
(ed. Liehr T)
Springer-Verlag, Germany, 2009, 451 p

Chapter 3. Yang F, Trifonov V, Ng BL, Kosyakova N, Carter NP. Generation of paint probes by flow-sorted and microdissected chromosomes. pp 35-52
Chapter 9. Trifonov VA, Vorobieva NN, Rens W. FISH with and without COT1 DNA. pp 99-112
Chapter 22. Liehr T, Mrasek K, Kosyakova N, Nelle H, Trifonov V, Manvelyan M, Weise A. FISH banding techniques. pp 243-250
Chapter 29. Yang F, Graphodatsky AS. Animal probes and ZOO-FISH. pp 323-346
Коряков ДЕ, Жимулев ИФ
Хромосомы. Структура и функции
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2009, 258 с
Природа Академгородка: 50 лет спустя
(отв. ред. Жимулев ИФ)
Новосибирск, Издательство СО РАН, 2007. 250 с
Atlas of mammalian chromosomes
(eds. O’Brien SJ, Nash WG, Menninger JC)
John Wiley and Sons Publishers, USA, 2006, 714 p

Graphodatsky AS. Contributed karyotypes: 15, 44, 52, 177-180; 182-183; 187; 188; 200-216; 218; 220-221; 237-239; 241-252; 255-262; 264-268; 275; 277-278; 279; 281-283; 286-287; 310; 314-319; 322; 324, 341; 346; 360; 362-365; 366-369; 372-373; 374; 375-376; 377; 367-368; 462; 484-493; 494; 496; 497; 500; 509; 566; 574; 587; 591-592; 606; 610; 611; 649-650; 671; 652-653
Methods in Molecular Biology
V. 247: Drosophila Cytogenetics Protocols

(ed. DS Henderson)
Humana Press, USA, 2003, 468 p

Chapter 6. Koryakov DE, Mal’ceva NI, King RC, Zhimulev IF. Polytene chromosomes from ovarian nurse cells of Drosophila melanogaster otu mutants. pp 139-161
Chapter 15. Semeshin VF, Belyaeva ES, Shloma VV, Zhimulev IF. Electron microscopy of polytene chromosomes. pp 305-324
Жимулев ИФ
Общая и молекулярная генетика (Учебное пособие для вузов)
Новосибирск, Сибирское университетское издательство
2002, 458 с (Первое издание)
2003, 478 с (Второе издание)
2006, 480 с (Третье издание)
2007, 479 с (Четвертое издание)
Графодатский АС и др.
Генетика собаки
Издательство Новосибирского университета, 1999, 196 с
Zhimulev IF
Genetic organization of polytene chromosomes
Adv Genet 39, 1999, 599 p
Zhimulev IF
Heterochromatin and position effect variegation
Adv Genet 37, 1998, 566 p
Zhimulev IF
Morphology and structure of polytene chromosomes
Adv Genet 34, 1996, 497 p
Жимулев ИФ
Хромомерная организация политенных хромосом
Новосибирск, Наука, 1994. 564 с
О'Брайен С, Робинсон Р, Графодатский АС и др.
Генетика кошки
(отв. ред. Бородин ПМ, Рувинский АО)
Новосибирск, Наука, 1993, 210 с
Жимулев ИФ
Гетерохроматин и эффект положения гена
Новосибирск, Наука, 1993, 490 с
Жимулев ИФ
Политенные хромосомы: морфология и структура
Новосибирск, Наука, 1992, 478 с

Графодатский АС, Раджабли СИ
Хромосомы сельскохозяйственных и лабораторных млекопитающих. Атлас
Новосибирск, Наука, 1988, 127 с

Цитогенетика гибридов, мутаций и эволюция кариотипа
(отв. ред. Хвостова ВВ)
Новосибирск, Наука, 1977, 272 с

Глава 13. Раджабли СИ, Графодатский АС. Эволюция кариотипа млекопитающих
(структурные перестройки хромосом и гетерохроматин). с. 231-248